34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0584 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  88.81 
 
 
134 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  88.64 
 
 
132 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  93.94 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  98.5 
 
 
133 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  98.5 
 
 
133 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  85.61 
 
 
133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  72 
 
 
133 aa  146  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2491  hypothetical protein  61.48 
 
 
133 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3453  hypothetical protein  61.48 
 
 
133 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1271  hypothetical protein  61.48 
 
 
133 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0411  hypothetical protein  61.48 
 
 
133 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3490  hypothetical protein  61.48 
 
 
133 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3491  hypothetical protein  61.48 
 
 
165 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3294  hypothetical protein  61.48 
 
 
160 aa  142  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5196  hypothetical protein  34.19 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  41.43 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  41.43 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  33.02 
 
 
120 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.33 
 
 
205 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4746  hypothetical protein  33.05 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3421  hypothetical protein  33.05 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4096  hypothetical protein  33.05 
 
 
139 aa  52  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  31.88 
 
 
205 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5191  hypothetical protein  32.77 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0884  hypothetical protein  39.68 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  39.29 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1553  hypothetical protein  40.32 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.787246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  36.51 
 
 
105 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2165  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  29.33 
 
 
194 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  39.22 
 
 
209 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>