31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3421 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4746  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3421  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  285  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4096  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  276  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5196  hypothetical protein  89.15 
 
 
142 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5191  hypothetical protein  87.2 
 
 
142 aa  224  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  90.76 
 
 
132 aa  220  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  95 
 
 
120 aa  207  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  59.22 
 
 
134 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  59.22 
 
 
134 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2491  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3453  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1271  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0411  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  34.19 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3490  hypothetical protein  31.75 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3294  hypothetical protein  31.75 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3491  hypothetical protein  31.75 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  37.35 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  36.67 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  37.36 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  37.36 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  35.56 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  31.11 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  32.43 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  36.36 
 
 
194 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  30.3 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  30.3 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  33.8 
 
 
105 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  40 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  33.9 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>