33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0517 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.528865  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0541  hypothetical protein  94.78 
 
 		 134 aa  226  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3698  hypothetical protein  86.36 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.386998  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  87.12 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  88.64 
 
 		 132 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  86.36 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  86.36 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2491  hypothetical protein  65.19 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3453  hypothetical protein  65.19 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1271  hypothetical protein  65.19 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0411  hypothetical protein  65.19 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1174  hypothetical protein  64.93 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3490  hypothetical protein  65.19 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3491  hypothetical protein  65.19 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3294  hypothetical protein  65.19 
 
 		 160 aa  153  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5196  hypothetical protein  34.55 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5191  hypothetical protein  37.38 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3359  hypothetical protein  34.55 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2758  hypothetical protein  32.41 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4746  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3421  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4096  hypothetical protein  33.64 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.38 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  32.81 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0884  hypothetical protein  37.35 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1553  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.787246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  36.51 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2165  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  35 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  30.14 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>