26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3579 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  62.9 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  60 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  38.61 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  36.54 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  49.12 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  47.37 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  46.97 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  49.21 
 
 		 205 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  50.85 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  48.21 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  57.78 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  48.15 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  44.12 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  37.1 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  39.71 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.88 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  44.68 
 
 		 212 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  35 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  34.67 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0584  hypothetical protein  29.76 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506035  hitchhiker  0.00941116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0616  hypothetical protein  29.07 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642122  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0133  hypothetical protein  29.07 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.165134  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  41.86 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.41 
 
 		 154 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>