25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2405 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  197  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  64.29 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  60.87 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  68.66 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  48.57 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  44.93 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  39.53 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  36.63 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  45.61 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  40.62 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  43.14 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  39.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  37.7 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  38.33 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0374  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0394  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  30.61 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  27.27 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  32.56 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  33.93 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  28.33 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  38 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2165  hypothetical protein  36.07 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  35.85 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>