18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1626 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  44.78 
 
 		 101 aa  50.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  36.36 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  36.36 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  34.23 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  37.33 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0097  calcium-binding EF-hand-containing protein  48.94 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  34.38 
 
 		 117 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  32.56 
 
 		 97 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0655  signal transduction protein  47.92 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  34.85 
 
 		 109 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  30.43 
 
 		 122 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0543  hypothetical protein  32.5 
 
 		 366 aa  41.2  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.337711  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  35.14 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  36.84 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  36.36 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>