24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2724 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3579  calcium-binding EF-hand  72.09 
 
 		 122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5773  hypothetical protein  62.5 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  42.27 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0389  hypothetical protein  37.86 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5853  hypothetical protein  35.11 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502913  normal  0.827274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2059a  hypothetical protein  45.45 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0984  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  44.44 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  44.44 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  42.65 
 
 		 190 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3880  hypothetical protein  53.33 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  44.12 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  41.38 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  35.71 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46530  hypothetical protein  40.91 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00204411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  36.46 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1626  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.47 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0042  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.46 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.352285  normal  0.420457 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0062  calcium-binding EF-hand-containing protein  32.46 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  38.14 
 
 		 125 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  43.86 
 
 		 212 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  25.81 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  37.84 
 
 		 213 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>