23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0064 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  83.26 
 
 		 212 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  37.88 
 
 		 266 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  32.47 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  34.44 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1140  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.57 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.229297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  30.49 
 
 		 242 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  26.17 
 
 		 143 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  40.54 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  29.75 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  29.14 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  30.46 
 
 		 148 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  41.67 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  41.67 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2968  calcium-binding EF-hand-containing protein  29.33 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  38.16 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  43.9 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2178  hypothetical protein  30.34 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0312897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2148  hypothetical protein  29.56 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.371725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  41.67 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0757  hypothetical protein  27.88 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2116  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  47.73 
 
 		 387 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2163  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  47.73 
 
 		 387 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273645  normal  0.931935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>