26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1629 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  100 
 
 		 170 aa  343  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5705  calcium-binding EF-hand-containing protein  81.43 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0268873  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  67.95 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  63.1 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  54.81 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  44.05 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0112  acid shock protein-like  42.25 
 
 		 126 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  39.73 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  44.93 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  39.73 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  42.59 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2724  calcium-binding EF-hand  36.04 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  43.18 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1363  signal transduction protein  47.83 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2405  hypothetical protein  30.61 
 
 		 97 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  37.31 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0065  signal transduction protein  40.23 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3772  hypothetical protein  30.89 
 
 		 106 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  30.48 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  40.68 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  39.47 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  28.83 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  40.91 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  37.5 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  40 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  38.64 
 
 		 136 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>