19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5798 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 97 aa  192  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  45.16 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  45.16 
 
 		 205 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  34 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  47.62 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04624  hypothetical protein  42 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3121  EF hand domain-containing protein  34.67 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  32.14 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  37.31 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.43 
 
 		 125 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  48.39 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1950  signal transduction protein  32.93 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  34.62 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0543  hypothetical protein  42.19 
 
 		 366 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04240  hypothetical protein  37.1 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0950  transport-associated  33.82 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.239728  normal  0.788848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1094  transport-associated  33.82 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  38 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04858  EF hand domain protein  29.35 
 
 		 193 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>