19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04241 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04241  EF hand domain protein  100 
 
 		 113 aa  220  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  75.47 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0543  hypothetical protein  49.06 
 
 		 366 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0267  calcium-binding EF-hand  42.86 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4424  calcium-binding EF-hand-containing protein  44.68 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163959  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  36.92 
 
 		 205 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  33.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  36.92 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1110  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.124565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0661  signal transduction protein  33.33 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.152046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0985  signal transduction protein  47.5 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0991  calcium-binding EF-hand-containing protein  34.83 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0245104  normal  0.296766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  44.68 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  40.98 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  35.14 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0640  putative signal transduction protein with EFhand domain  31.94 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  33.96 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04240  hypothetical protein  31.11 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1742  hypothetical protein  37.29 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>