16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2277 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  70 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5866  hypothetical protein  43.51 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4424  calcium-binding EF-hand-containing protein  54.12 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163959  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0152  signal transduction protein  58 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0847  calcium-binding EF-hand  57.14 
 
 		 185 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  44.07 
 
 		 266 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  39.51 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  33.33 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3545  signal transduction protein  50 
 
 		 209 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000138612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  34.57 
 
 		 205 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  45.1 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  47.73 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  37.5 
 
 		 390 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  48.78 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3976  signal transduction protein  47.83 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.895273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>