21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0450 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0450  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  517  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0081  Calcium-binding EF-hand-containing protein  39.62 
 
 		 212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0064  Calcium-binding EF-hand-containing protein  36.36 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.916763  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  38.52 
 
 		 209 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2277  calcium-binding EF-hand  45.76 
 
 		 155 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677939  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6104  calcium-binding protein  43.28 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2165  hypothetical protein  47.73 
 
 		 68 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0946  hypothetical protein  53.85 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.587997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1867  calcium-binding protein  43.28 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  43.86 
 
 		 139 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  29.19 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  33.87 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2073  signal transduction protein  42.31 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0851765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0833  Calcium-binding EF-hand-containing protein  50 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0359291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0346  Calcium-binding EF-hand-containing protein  55 
 
 		 136 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3042  putative signal transduction protein with EFhand domain protein  40 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.6189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3389  putative signal transduction protein with EFhand domain  40 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0795  Calcium-binding EF-hand-containing protein  39.29 
 
 		 396 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0440  calcium-binding EF-hand protein  29.19 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0765893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0416  calcium-binding EF-hand domain-containing protein  40.38 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2469  putative signal transduction protein with EFhand domain  43.33 
 
 		 125 aa  42  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>