13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0821 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0821  calcium-binding EF-hand-containing protein  100 
 
 		 138 aa  276  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.661714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1362  EF hand domain-containing protein  56.41 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0048155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2987  EF hand domain-containing protein  61.33 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  43.16 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0981  calcium-binding EF-hand  37.5 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49728  predicted protein  37.1 
 
 		 522 aa  42.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0014684  normal  0.217653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3121  EF hand domain-containing protein  36.21 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  37.29 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0305  hypothetical protein  29 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.178613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0847  calcium-binding EF-hand  41.67 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547407  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2030  calcium-binding EF-hand  36.36 
 
 		 251 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24253  predicted protein  44.23 
 
 		 479 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.334979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1228  signal transduction protein  32.76 
 
 		 145 aa  40  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522863  normal  0.321089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>