16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0139 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0139  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  336  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.13795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1114  hypothetical protein  36.75 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0883796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2148  calcium-binding EF-hand-containing protein  28.18 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  29.84 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4161  Calcium-binding EF-hand-containing protein  27.85 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0835  EF hand domain protein  44.44 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0950  signal transduction protein  27.88 
 
 		 242 aa  44.3  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  27.67 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1482  acid-shock protein  30.6 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0488  calcium-binding EF-hand  28.57 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0133587  normal  0.146102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  30.59 
 
 		 586 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1266  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.03 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.567  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4425  hypothetical protein  25 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.503951 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2120  putative signal transduction protein with EFhand domain  35 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3104  putative calcium binding signal peptide protein  29.6 
 
 		 194 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3148  hypothetical protein  27.33 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>