More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3206 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  100 
 
 
586 aa  1214    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  42.27 
 
 
535 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  39.84 
 
 
474 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  37.08 
 
 
565 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  40.29 
 
 
502 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  38.85 
 
 
499 aa  319  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  38.62 
 
 
493 aa  303  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  36.95 
 
 
535 aa  288  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  35.76 
 
 
511 aa  273  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  37.7 
 
 
466 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  34.97 
 
 
487 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  33.91 
 
 
523 aa  211  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  30.72 
 
 
509 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  30.68 
 
 
518 aa  188  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  31.58 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  30.26 
 
 
512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  29.91 
 
 
515 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  30.28 
 
 
510 aa  180  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  30.07 
 
 
505 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  29.69 
 
 
505 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  29.91 
 
 
505 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  29.84 
 
 
505 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  30.33 
 
 
503 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  29.07 
 
 
511 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  30.13 
 
 
517 aa  170  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  28.48 
 
 
513 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  29.39 
 
 
501 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  29.39 
 
 
501 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  29.42 
 
 
511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  28.78 
 
 
516 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  28.4 
 
 
520 aa  167  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  29.69 
 
 
517 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  29.42 
 
 
511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  29.69 
 
 
517 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  29.69 
 
 
522 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  29.69 
 
 
522 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  29.69 
 
 
522 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  29.69 
 
 
522 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  29.69 
 
 
522 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  28.48 
 
 
516 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  29.35 
 
 
594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  28.78 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  28.78 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  28.45 
 
 
473 aa  162  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  28.82 
 
 
502 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  26.43 
 
 
587 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  29.09 
 
 
501 aa  157  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  28.88 
 
 
501 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  28.16 
 
 
496 aa  155  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  27.84 
 
 
503 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  27.63 
 
 
489 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.48 
 
 
537 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  28.85 
 
 
482 aa  153  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  29.78 
 
 
501 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  28.05 
 
 
482 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  31.89 
 
 
502 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  26.45 
 
 
497 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  27.25 
 
 
505 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.74 
 
 
470 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  29.28 
 
 
486 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1808  sulfatase  25.38 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2827  sulfatase  26.76 
 
 
545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.99 
 
 
478 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  28.97 
 
 
494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.67 
 
 
497 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  26.68 
 
 
504 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  29.74 
 
 
479 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  29.82 
 
 
502 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.48 
 
 
512 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.97 
 
 
526 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.91 
 
 
564 aa  143  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  29.21 
 
 
504 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.78 
 
 
523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.93 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0945  sulfatase  28.48 
 
 
517 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3379  sulfatase  28.48 
 
 
517 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0996  sulfatase  28.48 
 
 
517 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.884308  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  27.73 
 
 
498 aa  141  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  23.36 
 
 
480 aa  140  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  28.8 
 
 
476 aa  140  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.42 
 
 
497 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  28.16 
 
 
526 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  28.57 
 
 
499 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.42 
 
 
497 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.08 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  24.85 
 
 
559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.08 
 
 
497 aa  138  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  26.23 
 
 
508 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  29.11 
 
 
497 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  24.75 
 
 
481 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  26.87 
 
 
480 aa  133  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  28.99 
 
 
502 aa  133  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  28.89 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  28.89 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  24.82 
 
 
511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  29.11 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  28.89 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.06 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.35 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4179  sulfatase  27.89 
 
 
514 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.10978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>