More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0564 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  71.46 
 
 		 501 aa  760    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  72.24 
 
 		 502 aa  784    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  70.61 
 
 		 504 aa  761    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  71.12 
 
 		 504 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  82.63 
 
 		 496 aa  866    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  68.31 
 
 		 498 aa  715    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  70.5 
 
 		 502 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  71.85 
 
 		 501 aa  764    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  72.24 
 
 		 501 aa  761    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  65.61 
 
 		 502 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  100 
 
 		 512 aa  1070    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  48.35 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  47.36 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  48.93 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  47.88 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  47.88 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  47.88 
 
 		 516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  48.08 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  48.74 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  47.44 
 
 		 518 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  48.32 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  48.32 
 
 		 505 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  47.93 
 
 		 505 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  47.45 
 
 		 510 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  48.32 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  46.69 
 
 		 517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  46.69 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  46.69 
 
 		 517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  46.69 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  46.69 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  46.69 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  46.69 
 
 		 517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  46.69 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  46.95 
 
 		 502 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  46.55 
 
 		 503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  45.16 
 
 		 515 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  45.03 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  45.58 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  46.08 
 
 		 513 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  45.87 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  44.99 
 
 		 501 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  49.65 
 
 		 594 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  41.91 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  42.45 
 
 		 503 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  31.38 
 
 		 489 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  32.04 
 
 		 482 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  29.94 
 
 		 476 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  30.79 
 
 		 474 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30.67 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  28.54 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  29.48 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  31.65 
 
 		 480 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  29.58 
 
 		 497 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  29.02 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  30.75 
 
 		 496 aa  151  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  27.25 
 
 		 565 aa  150  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  28.85 
 
 		 481 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  27.55 
 
 		 499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  27.23 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  26.71 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.16 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  27.37 
 
 		 493 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  27.44 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  26.11 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  27.48 
 
 		 586 aa  143  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  26.89 
 
 		 519 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  27.61 
 
 		 549 aa  139  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.63 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.12 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  27.71 
 
 		 572 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  28 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  27.73 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  26.94 
 
 		 478 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.57 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.57 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.57 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.57 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.76 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  28.98 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  29.37 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  27.2 
 
 		 554 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.11 
 
 		 497 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  24.84 
 
 		 512 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  25.16 
 
 		 499 aa  128  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.78 
 
 		 459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  28.13 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  26.34 
 
 		 537 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  26.7 
 
 		 535 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  26.37 
 
 		 517 aa  126  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  26.97 
 
 		 470 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  26.24 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  27.94 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  27.89 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  24.57 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  26.75 
 
 		 559 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  26.29 
 
 		 536 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  24.54 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  24.54 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  24.77 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  24.54 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>