More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0496 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  92.61 
 
 
501 aa  970    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  73.24 
 
 
496 aa  755    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  74.7 
 
 
502 aa  800    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  75.7 
 
 
502 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  71.43 
 
 
504 aa  766    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  77.84 
 
 
498 aa  803    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  93.01 
 
 
501 aa  973    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  76.59 
 
 
504 aa  794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  100 
 
 
501 aa  1035    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  72.24 
 
 
512 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  69.92 
 
 
502 aa  724    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  50.8 
 
 
509 aa  485  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  50.78 
 
 
516 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  50.78 
 
 
516 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  50.78 
 
 
516 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  50.79 
 
 
511 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  51.18 
 
 
516 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  50.2 
 
 
518 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  51.59 
 
 
511 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  50.79 
 
 
511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  49 
 
 
505 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  49.2 
 
 
505 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  48.91 
 
 
517 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  48.91 
 
 
522 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  48.51 
 
 
517 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  49.01 
 
 
512 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  48.91 
 
 
522 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  48.91 
 
 
522 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  48.91 
 
 
522 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  48.91 
 
 
517 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  48.91 
 
 
522 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  48.71 
 
 
502 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  48.72 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  49.2 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  49.5 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  48.41 
 
 
505 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  47.21 
 
 
510 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  47.63 
 
 
513 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  48.91 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  46.73 
 
 
501 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  46.34 
 
 
501 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  44.36 
 
 
520 aa  398  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  47.91 
 
 
594 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  42.92 
 
 
503 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  34.25 
 
 
489 aa  213  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31.37 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  30.82 
 
 
476 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  32.32 
 
 
497 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  29.71 
 
 
474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  30.45 
 
 
487 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  31.06 
 
 
486 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  32.26 
 
 
496 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  31.84 
 
 
480 aa  160  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  29.72 
 
 
535 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  28.63 
 
 
586 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  29.12 
 
 
523 aa  153  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  29.61 
 
 
511 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.68 
 
 
549 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  28.68 
 
 
514 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  29.98 
 
 
481 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  27.35 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  27.94 
 
 
499 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  28.41 
 
 
493 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  27.55 
 
 
565 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  26.73 
 
 
497 aa  144  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  26.73 
 
 
497 aa  143  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  26.73 
 
 
497 aa  143  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  26.73 
 
 
497 aa  143  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  26.73 
 
 
497 aa  143  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27.03 
 
 
497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.26 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  28.18 
 
 
459 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  29.01 
 
 
482 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  26.38 
 
 
535 aa  140  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  29.84 
 
 
449 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  27.62 
 
 
480 aa  139  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.58 
 
 
526 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  28.88 
 
 
479 aa  139  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  29.36 
 
 
489 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  27.78 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  28.45 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  31.15 
 
 
478 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  26.88 
 
 
489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.32 
 
 
478 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  29.06 
 
 
554 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  29.06 
 
 
497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  28.66 
 
 
483 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  25.43 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  30.02 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  27.82 
 
 
519 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.29 
 
 
498 aa  126  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  26.29 
 
 
536 aa  126  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  26.77 
 
 
572 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.95 
 
 
499 aa  126  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  28.38 
 
 
537 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  27.36 
 
 
523 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  26.52 
 
 
486 aa  124  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.09 
 
 
497 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  28.88 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.87 
 
 
497 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>