More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3903 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  100 
 
 
486 aa  1013    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  32.31 
 
 
478 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  32.89 
 
 
491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  31.06 
 
 
489 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  29.67 
 
 
479 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  30.5 
 
 
537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  27.03 
 
 
459 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  28.21 
 
 
505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  27.85 
 
 
470 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  29.12 
 
 
467 aa  148  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  27.25 
 
 
482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.22 
 
 
465 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  27.6 
 
 
457 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.94 
 
 
526 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.44 
 
 
512 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  28.82 
 
 
480 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.23 
 
 
497 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  29.05 
 
 
489 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  29.81 
 
 
515 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  29.9 
 
 
482 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.51 
 
 
499 aa  138  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  29.19 
 
 
520 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  26.45 
 
 
543 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  28.91 
 
 
492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  28.2 
 
 
553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  27.08 
 
 
490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  27.78 
 
 
554 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  27.79 
 
 
478 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.3 
 
 
471 aa  136  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  29.47 
 
 
497 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  29.62 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  26.38 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  28.27 
 
 
502 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  29.34 
 
 
511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.79 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  27.21 
 
 
478 aa  133  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  26.42 
 
 
549 aa  133  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  28.91 
 
 
535 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  28.43 
 
 
509 aa  133  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  27.31 
 
 
472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  28.9 
 
 
496 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  27.29 
 
 
480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  27.82 
 
 
485 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  25.24 
 
 
526 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  27.04 
 
 
510 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  28.73 
 
 
559 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  27.11 
 
 
457 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  24.88 
 
 
506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  27.63 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  27.63 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  28.91 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  27.63 
 
 
535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  27.65 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  28.39 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.51 
 
 
497 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.51 
 
 
497 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  27.21 
 
 
497 aa  128  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.51 
 
 
497 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.51 
 
 
497 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  25.31 
 
 
483 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  26.27 
 
 
471 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  28.38 
 
 
459 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0795  sulfatase  26.79 
 
 
549 aa  126  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0245615  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  27.61 
 
 
503 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  26.28 
 
 
572 aa  126  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.57 
 
 
497 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  28.28 
 
 
487 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  26.67 
 
 
462 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.76 
 
 
497 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.76 
 
 
497 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.76 
 
 
497 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  27.25 
 
 
631 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  26.09 
 
 
489 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  27.42 
 
 
494 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.78 
 
 
502 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.41 
 
 
497 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.76 
 
 
497 aa  124  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.98 
 
 
452 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4646  sulfatase  27.43 
 
 
461 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  27.11 
 
 
513 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  26.52 
 
 
501 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  26.72 
 
 
518 aa  124  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  27.06 
 
 
511 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  28.08 
 
 
564 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.23 
 
 
474 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  26.79 
 
 
578 aa  123  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  25.95 
 
 
778 aa  123  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  25.7 
 
 
502 aa  123  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  25.93 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  26.58 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  26.79 
 
 
510 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  28.3 
 
 
474 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.23 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  29.45 
 
 
565 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  25.74 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  26.38 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  27.09 
 
 
511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  27.16 
 
 
481 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  26.03 
 
 
554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  26.58 
 
 
505 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>