More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1574 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  59.51 
 
 		 549 aa  647    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  100 
 
 		 554 aa  1131    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  55.13 
 
 		 572 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  53 
 
 		 536 aa  534  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  49.24 
 
 		 518 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  47.38 
 
 		 523 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  35.1 
 
 		 512 aa  262  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  33.4 
 
 		 514 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  31.14 
 
 		 507 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  30.38 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  30.91 
 
 		 519 aa  203  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  30.52 
 
 		 519 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  28.6 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  30.14 
 
 		 526 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  32.02 
 
 		 494 aa  173  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  30.42 
 
 		 476 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  30.02 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  31.03 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  28.04 
 
 		 587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  28.65 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  31.66 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  28.79 
 
 		 509 aa  161  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  27.05 
 
 		 481 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  29.14 
 
 		 505 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  26.75 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  29.74 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  29.27 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  30.15 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  30 
 
 		 535 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  29.88 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  29.88 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  29.55 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  29.88 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  29.88 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  29.88 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  29.88 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  28.08 
 
 		 503 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  29.67 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  29.52 
 
 		 496 aa  150  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  28.19 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2621  sulfatase  28.6 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0161574  normal  0.118013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  28.76 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25.44 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.95 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  27.96 
 
 		 513 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  29.12 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  30.47 
 
 		 565 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  27.8 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  28.6 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  28.51 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  27.46 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  27.98 
 
 		 511 aa  144  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  27.89 
 
 		 498 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  29.48 
 
 		 497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  27.9 
 
 		 516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  27.37 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  27.9 
 
 		 516 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  27.9 
 
 		 516 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  27.76 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  27.78 
 
 		 486 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  29.36 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  31.71 
 
 		 474 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  27.82 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  29.06 
 
 		 501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.2 
 
 		 512 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  28.8 
 
 		 501 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  27.76 
 
 		 504 aa  130  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  26.51 
 
 		 453 aa  130  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  27.4 
 
 		 459 aa  130  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  28.8 
 
 		 501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  35.82 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.55 
 
 		 564 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  27.49 
 
 		 502 aa  127  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  29.24 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  28.02 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1306  sulfatase  28.54 
 
 		 498 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  26.8 
 
 		 497 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.18 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  26.6 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  26.6 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  29.52 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  34.05 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  26.6 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.16 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  33.53 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  35.09 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  30.7 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  31.31 
 
 		 501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  33.13 
 
 		 505 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  33.75 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  40.1 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  35.38 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  27.17 
 
 		 496 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  24.35 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  26.69 
 
 		 497 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  26.64 
 
 		 486 aa  117  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  26.63 
 
 		 487 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  27.55 
 
 		 442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  25 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.3 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>