More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3650 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  100 
 
 
482 aa  997    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  42.92 
 
 
510 aa  359  7e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  40.29 
 
 
470 aa  311  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  37.99 
 
 
492 aa  303  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  36.81 
 
 
478 aa  291  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  36.2 
 
 
631 aa  277  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  36.36 
 
 
490 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  36.03 
 
 
489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  34.25 
 
 
517 aa  252  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  35.04 
 
 
484 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  31.9 
 
 
724 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  32.79 
 
 
637 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  32.96 
 
 
471 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  31.04 
 
 
517 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  31.78 
 
 
465 aa  207  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  31.52 
 
 
472 aa  206  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  33.77 
 
 
453 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  32.1 
 
 
522 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  31.12 
 
 
500 aa  203  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  30.88 
 
 
562 aa  203  7e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  30.12 
 
 
553 aa  203  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  30.55 
 
 
513 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  30.53 
 
 
497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  30.21 
 
 
489 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  31.53 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  30.2 
 
 
479 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  29.46 
 
 
554 aa  194  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.44 
 
 
457 aa  193  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  28.16 
 
 
487 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30.72 
 
 
536 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  28.51 
 
 
452 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.15 
 
 
466 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29.11 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  33.05 
 
 
462 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.84 
 
 
548 aa  179  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  32.54 
 
 
474 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  29.43 
 
 
486 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.73 
 
 
497 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  27.98 
 
 
539 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.37 
 
 
457 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.17 
 
 
506 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  30.33 
 
 
523 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  28.45 
 
 
453 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  30.58 
 
 
543 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  29.77 
 
 
462 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.12 
 
 
500 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  31.22 
 
 
481 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.07 
 
 
501 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.91 
 
 
559 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.75 
 
 
495 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.75 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  31.28 
 
 
500 aa  167  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  30.09 
 
 
462 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  30.19 
 
 
486 aa  166  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  27.25 
 
 
551 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.2 
 
 
497 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.2 
 
 
497 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  30.31 
 
 
442 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.22 
 
 
497 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.22 
 
 
497 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  29.04 
 
 
467 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.7 
 
 
491 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  27.4 
 
 
440 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  26.98 
 
 
519 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  29.18 
 
 
438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.98 
 
 
497 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  29.87 
 
 
457 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  27.61 
 
 
551 aa  156  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  28.68 
 
 
578 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  31.04 
 
 
468 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  30.34 
 
 
491 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  27.84 
 
 
542 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  29.91 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  28.54 
 
 
483 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.46 
 
 
488 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  26.82 
 
 
627 aa  153  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  29.54 
 
 
453 aa  154  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  26.92 
 
 
542 aa  153  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.88 
 
 
553 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.31 
 
 
497 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  28.75 
 
 
481 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  25.98 
 
 
581 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  30.56 
 
 
480 aa  150  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.67 
 
 
482 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  27.48 
 
 
563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.82 
 
 
556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.14 
 
 
533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.05 
 
 
638 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  27.25 
 
 
486 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  26.82 
 
 
543 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  27.09 
 
 
582 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  27.05 
 
 
596 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  28.45 
 
 
442 aa  146  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  27.53 
 
 
537 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  27.33 
 
 
559 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  30.63 
 
 
471 aa  143  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  29.25 
 
 
555 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  27.53 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  26.42 
 
 
480 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  29.88 
 
 
554 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>