More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3801 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  100 
 
 
453 aa  944    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  41.19 
 
 
489 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  31.59 
 
 
501 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.77 
 
 
486 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  31.08 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  30.32 
 
 
539 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.45 
 
 
462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.93 
 
 
452 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  31.5 
 
 
474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  32.74 
 
 
631 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.08 
 
 
497 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  34 
 
 
506 aa  196  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  31.51 
 
 
490 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  30.35 
 
 
497 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  30.35 
 
 
497 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  30.35 
 
 
497 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.08 
 
 
480 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.35 
 
 
497 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.93 
 
 
470 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  31.42 
 
 
457 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  32.03 
 
 
492 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  33.03 
 
 
458 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  30.96 
 
 
510 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.19 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  31.75 
 
 
487 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  29.16 
 
 
468 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  31.87 
 
 
471 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  32.69 
 
 
472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.36 
 
 
497 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.44 
 
 
553 aa  182  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.64 
 
 
482 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  30.21 
 
 
486 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  29.89 
 
 
479 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  30.84 
 
 
519 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  28.95 
 
 
440 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.59 
 
 
500 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  29.91 
 
 
470 aa  179  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  30.37 
 
 
536 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  29.85 
 
 
481 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  28.17 
 
 
637 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.6 
 
 
481 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  31.14 
 
 
543 aa  177  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  30.62 
 
 
466 aa  176  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  31.3 
 
 
462 aa  175  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.45 
 
 
482 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  27.58 
 
 
517 aa  173  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.39 
 
 
465 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29 
 
 
500 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  28.95 
 
 
559 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  28.13 
 
 
548 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  30.02 
 
 
453 aa  169  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  27.97 
 
 
520 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  28.51 
 
 
488 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.09 
 
 
491 aa  166  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  29.49 
 
 
457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  27.24 
 
 
513 aa  162  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  27.29 
 
 
523 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  31.91 
 
 
638 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  27.78 
 
 
467 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  28.95 
 
 
459 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.2 
 
 
523 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  28.64 
 
 
484 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  28.02 
 
 
480 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  26.44 
 
 
503 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  29.93 
 
 
491 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.86 
 
 
470 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  27.72 
 
 
495 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  28.32 
 
 
500 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  27.29 
 
 
724 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  27.65 
 
 
438 aa  156  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  31.84 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  27.63 
 
 
546 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  25.49 
 
 
453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  27.63 
 
 
442 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  28.91 
 
 
489 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  27.66 
 
 
535 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  27.66 
 
 
535 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  27.66 
 
 
535 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  29.79 
 
 
440 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  28.57 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  27.15 
 
 
442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  28.57 
 
 
510 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  25.84 
 
 
522 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  26.24 
 
 
506 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  27.63 
 
 
471 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  26.74 
 
 
533 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  28.02 
 
 
551 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0829  sulfatase  26.61 
 
 
510 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0850119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  26.83 
 
 
457 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  27.65 
 
 
462 aa  143  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  24.75 
 
 
526 aa  143  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  28.48 
 
 
460 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  31.25 
 
 
569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  31.76 
 
 
569 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1780  sulfatase  28.81 
 
 
481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  29.59 
 
 
590 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  26.35 
 
 
483 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  28.15 
 
 
513 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  27.01 
 
 
609 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  28.32 
 
 
524 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>