More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0296 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  100 
 
 
442 aa  910    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  61.7 
 
 
438 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  61.49 
 
 
457 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  58.39 
 
 
453 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  58.05 
 
 
442 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  52.39 
 
 
482 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  50.35 
 
 
491 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  47.18 
 
 
471 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  47.04 
 
 
486 aa  382  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  46.23 
 
 
457 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  43.4 
 
 
462 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  37.53 
 
 
487 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  34.4 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  33.41 
 
 
472 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  33.98 
 
 
495 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  32.34 
 
 
500 aa  226  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  33.03 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  35.47 
 
 
465 aa  218  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  35.1 
 
 
453 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  35.21 
 
 
631 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  33.26 
 
 
467 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  32.77 
 
 
551 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  33.72 
 
 
470 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.94 
 
 
452 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  31.95 
 
 
517 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  33.8 
 
 
491 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  30.92 
 
 
553 aa  199  9e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.5 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  33.48 
 
 
481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  29.25 
 
 
539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  32.96 
 
 
474 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  33.03 
 
 
440 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.8 
 
 
533 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  32.1 
 
 
466 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.82 
 
 
543 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  28.81 
 
 
563 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  30.42 
 
 
489 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  34.71 
 
 
458 aa  186  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  31.25 
 
 
468 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  30.2 
 
 
484 aa  183  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  28.24 
 
 
558 aa  182  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  30.18 
 
 
486 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  30 
 
 
480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  31.01 
 
 
559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  31.07 
 
 
457 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  33.7 
 
 
488 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  34.13 
 
 
478 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.72 
 
 
497 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  26.29 
 
 
523 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.42 
 
 
548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  30.84 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  29.73 
 
 
584 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  29.93 
 
 
510 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  31.38 
 
 
490 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  28.12 
 
 
551 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  29.71 
 
 
462 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  29.68 
 
 
536 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  27.17 
 
 
582 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  28.19 
 
 
493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  28.78 
 
 
542 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  27.54 
 
 
571 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  27.24 
 
 
507 aa  166  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  31.12 
 
 
500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  28.89 
 
 
460 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  28.1 
 
 
492 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  30.31 
 
 
482 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.63 
 
 
497 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.63 
 
 
497 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29 
 
 
480 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.63 
 
 
497 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.63 
 
 
497 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.89 
 
 
506 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  30.49 
 
 
483 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  26.95 
 
 
553 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.57 
 
 
501 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  29.47 
 
 
489 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.57 
 
 
497 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  26.38 
 
 
535 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  26.38 
 
 
535 aa  156  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  28.97 
 
 
543 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  29.75 
 
 
459 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  29.8 
 
 
481 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  26.38 
 
 
535 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  28.34 
 
 
497 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  30.35 
 
 
560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  30.35 
 
 
560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  30.35 
 
 
560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  30.35 
 
 
539 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  30.35 
 
 
560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  28.95 
 
 
637 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  30.35 
 
 
560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  27.19 
 
 
536 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  27.84 
 
 
497 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.89 
 
 
440 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  27.24 
 
 
563 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  26.44 
 
 
536 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  31.22 
 
 
464 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  26.07 
 
 
536 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  28.1 
 
 
541 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  26.64 
 
 
506 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>