More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6751 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  90.69 
 
 
569 aa  1057    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  80.84 
 
 
556 aa  903    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  74.86 
 
 
556 aa  803    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  72.22 
 
 
561 aa  823    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  78.97 
 
 
590 aa  866    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  100 
 
 
569 aa  1170    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  72.2 
 
 
561 aa  814    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  79.53 
 
 
554 aa  907    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  78.88 
 
 
555 aa  894    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  35.08 
 
 
524 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  35.95 
 
 
526 aa  259  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  36.36 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  36.53 
 
 
515 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  32.81 
 
 
546 aa  253  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  34.42 
 
 
513 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  34.48 
 
 
564 aa  250  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  36.18 
 
 
554 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  33.65 
 
 
508 aa  248  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  35.37 
 
 
545 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  34.53 
 
 
557 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  34 
 
 
552 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  33.64 
 
 
521 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  35.61 
 
 
508 aa  237  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  33.73 
 
 
547 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  34.28 
 
 
505 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  34.28 
 
 
505 aa  233  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  33.66 
 
 
512 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  33.87 
 
 
502 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  33.86 
 
 
522 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  34.78 
 
 
544 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  33.73 
 
 
522 aa  232  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  33.46 
 
 
542 aa  229  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  33.08 
 
 
555 aa  227  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  33.27 
 
 
496 aa  226  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  33.79 
 
 
496 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  32.33 
 
 
552 aa  225  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  33.07 
 
 
567 aa  223  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  30.78 
 
 
514 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  30.78 
 
 
514 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  33.73 
 
 
525 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  33.78 
 
 
560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  32.6 
 
 
579 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  31.71 
 
 
549 aa  217  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  31.5 
 
 
533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  32.22 
 
 
512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  30.08 
 
 
505 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  30.59 
 
 
548 aa  212  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  30.53 
 
 
517 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  33.13 
 
 
522 aa  210  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.72 
 
 
440 aa  210  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  30.77 
 
 
470 aa  210  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  31.1 
 
 
512 aa  204  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33 
 
 
466 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.85 
 
 
480 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.9 
 
 
462 aa  194  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  32.22 
 
 
496 aa  190  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  29.35 
 
 
550 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.39 
 
 
486 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  30.58 
 
 
525 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.93 
 
 
452 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  31.98 
 
 
520 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  30.1 
 
 
551 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  30.1 
 
 
551 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  30.1 
 
 
551 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  29.7 
 
 
551 aa  172  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  29.7 
 
 
551 aa  171  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  31 
 
 
543 aa  170  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  31.32 
 
 
500 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.63 
 
 
497 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.35 
 
 
497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  33.03 
 
 
523 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  33.81 
 
 
458 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  30.4 
 
 
497 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.76 
 
 
471 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  30.19 
 
 
497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.19 
 
 
497 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  30.19 
 
 
497 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.32 
 
 
506 aa  163  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  30.06 
 
 
553 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  29.49 
 
 
503 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  31.26 
 
 
523 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  30.26 
 
 
440 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.45 
 
 
501 aa  161  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  28.68 
 
 
506 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  29.49 
 
 
526 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  30.17 
 
 
491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  28.92 
 
 
495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  31.06 
 
 
481 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  30.67 
 
 
487 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  28.86 
 
 
548 aa  153  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  30.79 
 
 
453 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  29.57 
 
 
468 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.26 
 
 
482 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.54 
 
 
497 aa  150  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  31.76 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  30.16 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  28.01 
 
 
526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  31.71 
 
 
474 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.96 
 
 
457 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  28.19 
 
 
506 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>