More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0984 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  100 
 
 
535 aa  1107    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  99.81 
 
 
535 aa  1107    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  99.81 
 
 
535 aa  1107    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  39.88 
 
 
560 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  39.69 
 
 
560 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  39.88 
 
 
560 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  39.69 
 
 
539 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  39.88 
 
 
560 aa  398  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  39.88 
 
 
560 aa  398  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1378  sulfatase  39.8 
 
 
557 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3148  sulfatase  39.8 
 
 
534 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  39.8 
 
 
534 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  33.08 
 
 
483 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29.12 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.48 
 
 
479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  26.43 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  27.55 
 
 
452 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.63 
 
 
500 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  27.24 
 
 
539 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.27 
 
 
471 aa  176  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.44 
 
 
465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  27.95 
 
 
472 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  24.76 
 
 
457 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  28.63 
 
 
553 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  26.28 
 
 
501 aa  166  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  28.54 
 
 
558 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  28.54 
 
 
495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  26.1 
 
 
467 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  27.24 
 
 
490 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  27.08 
 
 
486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.16 
 
 
497 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  25.42 
 
 
462 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  27.12 
 
 
457 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  27.2 
 
 
492 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.98 
 
 
497 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.94 
 
 
497 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.64 
 
 
559 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  25.66 
 
 
491 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.76 
 
 
497 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  28.24 
 
 
551 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  25.69 
 
 
489 aa  157  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.12 
 
 
497 aa  156  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  26.38 
 
 
442 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  24.51 
 
 
480 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.88 
 
 
474 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.97 
 
 
491 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  26.78 
 
 
510 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  27.66 
 
 
453 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  26.82 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  28.63 
 
 
484 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  27.81 
 
 
543 aa  148  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  25.76 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  26.65 
 
 
536 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.02 
 
 
497 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  25.4 
 
 
497 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  26.25 
 
 
480 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  24.25 
 
 
478 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  25.95 
 
 
466 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  25.82 
 
 
631 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  24.8 
 
 
482 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  27.67 
 
 
548 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  26.2 
 
 
481 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  24.67 
 
 
519 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  26.19 
 
 
462 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  28.6 
 
 
506 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  25.47 
 
 
486 aa  140  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  26.39 
 
 
442 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  26.1 
 
 
497 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  24.31 
 
 
440 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  26.72 
 
 
458 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  24.91 
 
 
470 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.47 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  25.84 
 
 
638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  26.74 
 
 
517 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  26.79 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  25.18 
 
 
471 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  25.62 
 
 
522 aa  133  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  23.01 
 
 
627 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  27.26 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  25 
 
 
489 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  28.4 
 
 
457 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  25.73 
 
 
459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  25.09 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  27.63 
 
 
486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  23.71 
 
 
772 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  23.97 
 
 
533 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  25.1 
 
 
468 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  25.92 
 
 
500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  27.17 
 
 
491 aa  125  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  26.39 
 
 
481 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  24.18 
 
 
488 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  25.28 
 
 
523 aa  125  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  25.52 
 
 
489 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  26.93 
 
 
467 aa  125  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  25.04 
 
 
563 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  22.75 
 
 
571 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  26.63 
 
 
464 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  25.4 
 
 
582 aa  124  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  22.57 
 
 
517 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  26.38 
 
 
506 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>