More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3660 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  100 
 
 
523 aa  1079    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  59.7 
 
 
526 aa  665    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  54.68 
 
 
523 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  56.16 
 
 
503 aa  571  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  54.98 
 
 
506 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  52.49 
 
 
520 aa  534  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  51.23 
 
 
507 aa  518  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  50.6 
 
 
520 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  50.41 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  46.86 
 
 
505 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  46.68 
 
 
526 aa  420  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  34.02 
 
 
522 aa  261  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  34.05 
 
 
506 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  35.09 
 
 
523 aa  248  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  33.01 
 
 
493 aa  236  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.62 
 
 
466 aa  216  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  32.18 
 
 
480 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.89 
 
 
486 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  31.6 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  30.48 
 
 
470 aa  196  7e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0829  sulfatase  31.4 
 
 
510 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0850119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  28.77 
 
 
440 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  29.09 
 
 
440 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.25 
 
 
458 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.45 
 
 
501 aa  176  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.38 
 
 
497 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  29.02 
 
 
523 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  28.57 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  30.56 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  29.63 
 
 
488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.12 
 
 
506 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  31.63 
 
 
524 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  27.29 
 
 
453 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.05 
 
 
497 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.05 
 
 
497 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  27.32 
 
 
539 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.05 
 
 
497 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.55 
 
 
479 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.85 
 
 
497 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.13 
 
 
497 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  26.95 
 
 
500 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  29.6 
 
 
484 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.31 
 
 
474 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.86 
 
 
519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  28.38 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.1 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  27.55 
 
 
536 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  29.38 
 
 
508 aa  148  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.32 
 
 
471 aa  148  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  26.25 
 
 
471 aa  147  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  26.16 
 
 
472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  29.2 
 
 
551 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  29.2 
 
 
551 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  29.2 
 
 
551 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  29.26 
 
 
551 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  26.41 
 
 
492 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  29.26 
 
 
551 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  25.36 
 
 
487 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  29.24 
 
 
496 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  30.57 
 
 
510 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  24.47 
 
 
548 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  25.87 
 
 
500 aa  141  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  26.42 
 
 
495 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  27.33 
 
 
542 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  28.57 
 
 
543 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  27.47 
 
 
500 aa  140  7.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  26.29 
 
 
438 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  30.75 
 
 
554 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  28.11 
 
 
457 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  27.97 
 
 
544 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  31.44 
 
 
545 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  27.5 
 
 
453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.1 
 
 
553 aa  136  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  26.12 
 
 
491 aa  137  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  31.51 
 
 
513 aa  136  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  29.43 
 
 
550 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  25.74 
 
 
627 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  24.9 
 
 
522 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  32.14 
 
 
521 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  31.74 
 
 
552 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  26.03 
 
 
442 aa  133  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  28.6 
 
 
508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  29.5 
 
 
457 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  28.7 
 
 
505 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  25.87 
 
 
462 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  30.98 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  27.77 
 
 
556 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  28.48 
 
 
505 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.42 
 
 
440 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  26.95 
 
 
526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  27.54 
 
 
567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  32.33 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  30.36 
 
 
547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  24.95 
 
 
470 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  28.38 
 
 
561 aa  127  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  25.39 
 
 
491 aa  126  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  30.36 
 
 
557 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  25.65 
 
 
551 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  25.68 
 
 
460 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  26.33 
 
 
536 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>