More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0819 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  100 
 
 
523 aa  1085    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  54.68 
 
 
523 aa  585  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  58.08 
 
 
526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  53.54 
 
 
503 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  52.17 
 
 
506 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  53.31 
 
 
507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  52.36 
 
 
520 aa  511  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  50.21 
 
 
520 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  47.45 
 
 
503 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  47.01 
 
 
505 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  45.69 
 
 
526 aa  427  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  32.29 
 
 
522 aa  246  6.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  32.62 
 
 
506 aa  244  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  33.71 
 
 
523 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  34.07 
 
 
493 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  31.92 
 
 
462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  30.3 
 
 
466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  32.02 
 
 
486 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.1 
 
 
480 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  28.8 
 
 
458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0829  sulfatase  31.43 
 
 
510 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0850119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  28.37 
 
 
440 aa  178  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  28.32 
 
 
523 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.59 
 
 
497 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.72 
 
 
471 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.88 
 
 
501 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.92 
 
 
497 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.96 
 
 
497 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  27.6 
 
 
539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.24 
 
 
470 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  27.66 
 
 
440 aa  163  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.85 
 
 
497 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.72 
 
 
497 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.85 
 
 
497 aa  160  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  30.23 
 
 
543 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.66 
 
 
497 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  29.24 
 
 
440 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  26.87 
 
 
506 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  28.95 
 
 
481 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  27.4 
 
 
551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  29.11 
 
 
524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  26.22 
 
 
492 aa  154  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  28.19 
 
 
551 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  28.02 
 
 
452 aa  153  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  27.4 
 
 
551 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  25.8 
 
 
470 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  27.4 
 
 
551 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  27.4 
 
 
551 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  28.61 
 
 
496 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  28.24 
 
 
508 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  27.59 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  26.06 
 
 
500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  29.07 
 
 
481 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.58 
 
 
553 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  26.78 
 
 
488 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  26.85 
 
 
500 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  28.05 
 
 
590 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  27.49 
 
 
470 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  27.11 
 
 
556 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  24.95 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  27.24 
 
 
627 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  27.54 
 
 
631 aa  140  7e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  27.85 
 
 
550 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.94 
 
 
559 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  25.81 
 
 
551 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  25.84 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  27.8 
 
 
460 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  26.43 
 
 
468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  29.78 
 
 
510 aa  133  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  25.2 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  23.78 
 
 
489 aa  131  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  26.05 
 
 
569 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  26.47 
 
 
555 aa  130  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  24.8 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  26.11 
 
 
512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  24.16 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  25.59 
 
 
554 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  24.74 
 
 
536 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  27.93 
 
 
502 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  24.57 
 
 
536 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  26.25 
 
 
569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  28.22 
 
 
522 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  24.65 
 
 
442 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  28.11 
 
 
472 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  26.22 
 
 
536 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  27.06 
 
 
552 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  25.89 
 
 
497 aa  124  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  26.16 
 
 
556 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  29.08 
 
 
505 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  26.52 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  26.05 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  26.24 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  29.08 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  26.39 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  28.22 
 
 
508 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  27.83 
 
 
545 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  26.29 
 
 
534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  25.53 
 
 
561 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  27.84 
 
 
500 aa  120  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  24.85 
 
 
438 aa  120  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>