More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4261 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  61.65 
 
 
507 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  100 
 
 
506 aa  1041    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  60.79 
 
 
520 aa  612  9.999999999999999e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  54.2 
 
 
503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  56.37 
 
 
520 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  57.2 
 
 
526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  54.98 
 
 
523 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  55.58 
 
 
503 aa  542  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  53.4 
 
 
505 aa  537  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  50.79 
 
 
523 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  50.2 
 
 
526 aa  485  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  37.48 
 
 
506 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  35.39 
 
 
522 aa  283  6.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  36.52 
 
 
523 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  35.09 
 
 
493 aa  270  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  32.88 
 
 
480 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.79 
 
 
462 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.03 
 
 
466 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.32 
 
 
497 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.27 
 
 
486 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0829  sulfatase  30.41 
 
 
510 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0850119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  31.08 
 
 
458 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  29.35 
 
 
523 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  30.82 
 
 
440 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  27.01 
 
 
440 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.7 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  30.28 
 
 
488 aa  172  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.51 
 
 
506 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 
457 aa  167  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  26.57 
 
 
470 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  29.63 
 
 
517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.85 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  28.83 
 
 
481 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  29.4 
 
 
481 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.63 
 
 
468 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.64 
 
 
500 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  28.19 
 
 
543 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  28.41 
 
 
480 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  26.6 
 
 
539 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  27.2 
 
 
492 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.26 
 
 
479 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.96 
 
 
497 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  27.77 
 
 
460 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  28.73 
 
 
515 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  27.02 
 
 
470 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  26.34 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  25.62 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  26.8 
 
 
440 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  26.05 
 
 
453 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  25.81 
 
 
497 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  29.47 
 
 
496 aa  147  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.25 
 
 
553 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  27.24 
 
 
551 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  25.86 
 
 
497 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  26.8 
 
 
551 aa  144  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  25.86 
 
 
497 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  26.84 
 
 
462 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  28.11 
 
 
554 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  27.71 
 
 
569 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  27.34 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.06 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  26.6 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  26.51 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  27.17 
 
 
500 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  26.6 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  26.6 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  26.4 
 
 
551 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  29.42 
 
 
521 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  27.79 
 
 
497 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  28.96 
 
 
569 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  29 
 
 
555 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  28.54 
 
 
555 aa  140  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  27.8 
 
 
512 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  27.85 
 
 
536 aa  140  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.71 
 
 
491 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  26.93 
 
 
491 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  29.3 
 
 
561 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  27.79 
 
 
561 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  26.55 
 
 
517 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  28.22 
 
 
496 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  26.13 
 
 
500 aa  136  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  26.61 
 
 
522 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  29.85 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  29.18 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  26.89 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  26.94 
 
 
489 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  28.46 
 
 
631 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  28.42 
 
 
496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  27.38 
 
 
556 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  29.09 
 
 
550 aa  134  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  29.41 
 
 
505 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  27.46 
 
 
526 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  26.57 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  27.87 
 
 
542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  29.32 
 
 
545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  26.63 
 
 
453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  26.79 
 
 
544 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  29.24 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  27.32 
 
 
555 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  26.95 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>