More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2602 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  100 
 
 
452 aa  951    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  39.3 
 
 
495 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  33.62 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  34.77 
 
 
440 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  33.95 
 
 
472 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  36.14 
 
 
487 aa  247  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  34.81 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  34.43 
 
 
479 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  33.4 
 
 
497 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  33.61 
 
 
497 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  33.4 
 
 
470 aa  239  8e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 
457 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  33.4 
 
 
497 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  33.4 
 
 
497 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  33.4 
 
 
497 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.9 
 
 
539 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  31.53 
 
 
471 aa  237  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  34.33 
 
 
501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  34.64 
 
 
548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  34.73 
 
 
453 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  34.99 
 
 
462 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  33.26 
 
 
468 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  33.4 
 
 
497 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  33.63 
 
 
491 aa  230  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.71 
 
 
486 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  33.18 
 
 
482 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.9 
 
 
466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.33 
 
 
497 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  32.51 
 
 
486 aa  226  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  32.83 
 
 
480 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  34.71 
 
 
506 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  30.98 
 
 
523 aa  222  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  35.8 
 
 
458 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  34.75 
 
 
465 aa  216  5e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  31.84 
 
 
471 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  34.23 
 
 
481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  30.83 
 
 
510 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.04 
 
 
553 aa  213  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  31.43 
 
 
491 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.49 
 
 
543 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  31.65 
 
 
438 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  32.58 
 
 
440 aa  211  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  32.16 
 
 
500 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  31.39 
 
 
488 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  29.4 
 
 
462 aa  209  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  30.94 
 
 
442 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  32.46 
 
 
481 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  32.2 
 
 
457 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  31.51 
 
 
467 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  31.53 
 
 
484 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  31.59 
 
 
559 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  32.75 
 
 
457 aa  203  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  32.3 
 
 
474 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  31.25 
 
 
536 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  28.7 
 
 
517 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  31.92 
 
 
631 aa  200  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  29.93 
 
 
453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  31.22 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  30.6 
 
 
558 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  30.21 
 
 
489 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  32.09 
 
 
459 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  29.56 
 
 
490 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  29.64 
 
 
533 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  31.15 
 
 
453 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  30.39 
 
 
507 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  29.89 
 
 
551 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  29.85 
 
 
492 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  30.75 
 
 
500 aa  189  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.71 
 
 
553 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  29.19 
 
 
543 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  27.55 
 
 
535 aa  184  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  27.55 
 
 
535 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  27.55 
 
 
535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  29.31 
 
 
478 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  30.02 
 
 
480 aa  183  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.51 
 
 
482 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.57 
 
 
460 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  30.78 
 
 
503 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  30.46 
 
 
480 aa  180  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  28.07 
 
 
555 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  29.03 
 
 
526 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  30.18 
 
 
497 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.38 
 
 
519 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  29.93 
 
 
569 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  28.21 
 
 
563 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.69 
 
 
638 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  30.24 
 
 
637 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  27.62 
 
 
551 aa  173  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  31.34 
 
 
556 aa  172  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  29 
 
 
569 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  27.55 
 
 
584 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  29.21 
 
 
513 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  27.53 
 
 
542 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  28.52 
 
 
582 aa  170  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  30.21 
 
 
521 aa  169  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  29.75 
 
 
508 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42934  arylsulfatase  28.79 
 
 
564 aa  169  9e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  26.96 
 
 
526 aa  168  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  30.49 
 
 
462 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  29.48 
 
 
470 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>