More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2976 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  100 
 
 
496 aa  1026    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  44.87 
 
 
470 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  45.91 
 
 
440 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  35.84 
 
 
462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  33.72 
 
 
508 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  31.24 
 
 
524 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  34.95 
 
 
486 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  30.82 
 
 
521 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  32.8 
 
 
505 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  32.26 
 
 
552 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  32.8 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  32.49 
 
 
510 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  32.61 
 
 
526 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  32.52 
 
 
545 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  31.49 
 
 
515 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  31.6 
 
 
579 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  32.04 
 
 
552 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  30.97 
 
 
557 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  32.56 
 
 
522 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  33.56 
 
 
496 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  31.91 
 
 
567 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  31.5 
 
 
496 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  30.51 
 
 
555 aa  199  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  31.35 
 
 
544 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  31.82 
 
 
512 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  32.75 
 
 
480 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  29.87 
 
 
513 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  31.14 
 
 
512 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  29.94 
 
 
560 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  30.93 
 
 
547 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  29.86 
 
 
550 aa  193  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  30.96 
 
 
522 aa  193  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.18 
 
 
466 aa  193  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  28.8 
 
 
551 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  30 
 
 
522 aa  190  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  31.74 
 
 
554 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  29.14 
 
 
508 aa  189  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  30.36 
 
 
502 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  28.57 
 
 
551 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  28.57 
 
 
551 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  28.57 
 
 
551 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  28.57 
 
 
551 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  30.95 
 
 
548 aa  187  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  30.33 
 
 
514 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  30.33 
 
 
514 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  32.38 
 
 
569 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  30.14 
 
 
549 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  27.98 
 
 
525 aa  180  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  29.5 
 
 
542 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  30.41 
 
 
505 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  30.74 
 
 
590 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  30.42 
 
 
533 aa  170  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  30.84 
 
 
561 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.99 
 
 
458 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  30.65 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  30.48 
 
 
554 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  30.38 
 
 
561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  30.37 
 
 
564 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  29.66 
 
 
556 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  32.21 
 
 
569 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  28.63 
 
 
517 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  30.35 
 
 
555 aa  163  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  28.69 
 
 
520 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  26.96 
 
 
546 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  27.65 
 
 
523 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  28.21 
 
 
512 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  28.6 
 
 
525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  28.84 
 
 
522 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  29.07 
 
 
556 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  32.17 
 
 
497 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  30.26 
 
 
503 aa  153  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  28.91 
 
 
471 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29.3 
 
 
470 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.94 
 
 
523 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  29.62 
 
 
507 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  30.67 
 
 
543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  29.53 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  28.5 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  27.73 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  30.43 
 
 
523 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  29.16 
 
 
523 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  27.79 
 
 
526 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  30.59 
 
 
505 aa  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.53 
 
 
553 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  28.24 
 
 
500 aa  144  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  28.09 
 
 
440 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  28.3 
 
 
500 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  27.66 
 
 
465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  27.97 
 
 
503 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  24.11 
 
 
472 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  29.81 
 
 
506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.52 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.85 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  26.3 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  28.31 
 
 
520 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  27.32 
 
 
495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  25.05 
 
 
548 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  27.81 
 
 
481 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  28.02 
 
 
452 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>