More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3659 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  100 
 
 
484 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  34.45 
 
 
631 aa  265  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  35.48 
 
 
517 aa  262  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  37.45 
 
 
510 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  34.03 
 
 
492 aa  249  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  35.46 
 
 
470 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  34.14 
 
 
490 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  34.61 
 
 
482 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  33.06 
 
 
478 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  32.11 
 
 
539 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  32.01 
 
 
470 aa  216  9e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  31.89 
 
 
472 aa  213  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.39 
 
 
453 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.64 
 
 
553 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  33.56 
 
 
724 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  31.57 
 
 
489 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.13 
 
 
457 aa  204  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  31.53 
 
 
452 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.78 
 
 
501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  31.98 
 
 
551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  31.19 
 
 
479 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  32.22 
 
 
522 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.94 
 
 
500 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.16 
 
 
497 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  31.65 
 
 
548 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  30.83 
 
 
497 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  31.53 
 
 
536 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  32.75 
 
 
487 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  30.77 
 
 
513 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.91 
 
 
497 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29.52 
 
 
500 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.91 
 
 
497 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.91 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.91 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.41 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  31.58 
 
 
559 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  31.95 
 
 
471 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  30.85 
 
 
637 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.35 
 
 
466 aa  187  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  31.51 
 
 
517 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.8 
 
 
506 aa  186  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  32.09 
 
 
482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  30.2 
 
 
442 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  29.87 
 
 
523 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  28.23 
 
 
462 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  28.85 
 
 
542 aa  181  4e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.77 
 
 
457 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  27.26 
 
 
543 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29.59 
 
 
495 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  30.8 
 
 
471 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  28.02 
 
 
554 aa  178  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  29.15 
 
 
462 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  28.31 
 
 
542 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.36 
 
 
481 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  30.33 
 
 
468 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  28.31 
 
 
486 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  27.79 
 
 
486 aa  176  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  27.86 
 
 
562 aa  174  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  29.49 
 
 
440 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.72 
 
 
497 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.84 
 
 
474 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  27.47 
 
 
533 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  33.69 
 
 
465 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  29.48 
 
 
481 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  30.2 
 
 
457 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  28.43 
 
 
500 aa  169  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  28.27 
 
 
543 aa  168  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  26.47 
 
 
553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  28.85 
 
 
526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  28.19 
 
 
526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  29.14 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  26.6 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  31.29 
 
 
491 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  30.06 
 
 
488 aa  164  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  28.57 
 
 
458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.98 
 
 
491 aa  163  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  28.46 
 
 
467 aa  163  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.24 
 
 
519 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  28.79 
 
 
506 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  28.19 
 
 
551 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  25.69 
 
 
555 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  28.85 
 
 
489 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  28.64 
 
 
453 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  25.93 
 
 
560 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  26.12 
 
 
560 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  26.12 
 
 
539 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  25.93 
 
 
560 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  25.93 
 
 
560 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  25.93 
 
 
560 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  28.1 
 
 
558 aa  158  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  27.48 
 
 
483 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  28.6 
 
 
480 aa  157  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  31.62 
 
 
462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  27.48 
 
 
520 aa  156  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  28.55 
 
 
507 aa  156  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  29.05 
 
 
503 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  29.2 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  28.64 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  32.63 
 
 
508 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  26.32 
 
 
778 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>