More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4498 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  74.18 
 
 		 486 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  100 
 
 		 462 aa  953    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  51.84 
 
 		 480 aa  501  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  46.07 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  45.05 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  41.01 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  39.21 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  36.08 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  35.66 
 
 		 497 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  34.28 
 
 		 470 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  37.44 
 
 		 440 aa  249  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  36.71 
 
 		 481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  34.59 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  34.4 
 
 		 472 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  32.22 
 
 		 520 aa  236  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  35.64 
 
 		 510 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  33.06 
 
 		 493 aa  233  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  34.99 
 
 		 452 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  36.44 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  34.56 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  34.62 
 
 		 474 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  34.91 
 
 		 552 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  34.06 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  35.48 
 
 		 547 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  33.87 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  35.79 
 
 		 496 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  33.54 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  34.59 
 
 		 557 aa  227  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  33.18 
 
 		 471 aa  226  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  34.36 
 
 		 523 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  32.65 
 
 		 470 aa  223  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  32.74 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  36.96 
 
 		 521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.66 
 
 		 539 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  35.57 
 
 		 515 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  32.46 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  34.23 
 
 		 496 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  32.86 
 
 		 503 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  32.65 
 
 		 523 aa  216  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  31.92 
 
 		 523 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  33.33 
 
 		 526 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  35.19 
 
 		 543 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  34.51 
 
 		 522 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  35.22 
 
 		 546 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  32.24 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  35.89 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  32.45 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  33.63 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  33.33 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  35.32 
 
 		 508 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  33.76 
 
 		 500 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  32.9 
 
 		 555 aa  210  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  34.08 
 
 		 508 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  33.49 
 
 		 479 aa  210  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  34 
 
 		 544 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  35.01 
 
 		 525 aa  209  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  33.55 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  33.41 
 
 		 567 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  34.46 
 
 		 513 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  30.78 
 
 		 526 aa  205  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  35.47 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  31.28 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  32.75 
 
 		 481 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  35.22 
 
 		 505 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  32.92 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  35.29 
 
 		 560 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  33.19 
 
 		 553 aa  203  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.14 
 
 		 470 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  31.39 
 
 		 505 aa  202  8e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  35.58 
 
 		 545 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  32.74 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  31.6 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  32.49 
 
 		 512 aa  201  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  32.45 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  33.12 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  33.87 
 
 		 487 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  34.22 
 
 		 549 aa  200  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  34 
 
 		 491 aa  199  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  30.83 
 
 		 522 aa  199  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  33.77 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.53 
 
 		 495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  31.14 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  33.17 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  32.97 
 
 		 564 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  34.16 
 
 		 548 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  32.06 
 
 		 497 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  32.06 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  32.06 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  32.06 
 
 		 497 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  30.88 
 
 		 480 aa  194  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  32.21 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  31.73 
 
 		 482 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.77 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  31.67 
 
 		 514 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  31.67 
 
 		 514 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  34.52 
 
 		 524 aa  192  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  32.27 
 
 		 522 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  33.83 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  32.48 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  31.87 
 
 		 497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>