More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3115 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  76.59 
 
 
470 aa  704    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  100 
 
 
440 aa  910    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  45.91 
 
 
496 aa  395  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  37.44 
 
 
462 aa  249  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  37.26 
 
 
486 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  35.24 
 
 
466 aa  240  4e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  32.24 
 
 
524 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  31.47 
 
 
515 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  29.52 
 
 
513 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  31.95 
 
 
556 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  31.22 
 
 
510 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  31.5 
 
 
496 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  30.8 
 
 
551 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  30.8 
 
 
551 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  30.8 
 
 
551 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  30.8 
 
 
551 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  36.34 
 
 
458 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  30.92 
 
 
547 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  30.59 
 
 
551 aa  209  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  30.49 
 
 
496 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  31.21 
 
 
557 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  30.07 
 
 
508 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  31.88 
 
 
544 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  34.06 
 
 
508 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  30.95 
 
 
521 aa  206  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.59 
 
 
480 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  29.53 
 
 
505 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  29.31 
 
 
505 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  32.41 
 
 
520 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  31.34 
 
 
526 aa  203  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  30.84 
 
 
552 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  30.47 
 
 
514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  30.47 
 
 
514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  28.94 
 
 
552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  28.85 
 
 
550 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  30.05 
 
 
522 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  31.74 
 
 
561 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  31.64 
 
 
512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  29.83 
 
 
548 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  31.79 
 
 
560 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  30.43 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  29.98 
 
 
549 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  32.57 
 
 
561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  30.2 
 
 
545 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  30.31 
 
 
505 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  28.93 
 
 
542 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  33.25 
 
 
440 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  31.26 
 
 
554 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  30.75 
 
 
555 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  30.86 
 
 
569 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  29.01 
 
 
555 aa  190  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  27 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  30.13 
 
 
567 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  30.35 
 
 
556 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  29.09 
 
 
523 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  29.61 
 
 
522 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  27.27 
 
 
517 aa  186  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  30.04 
 
 
569 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  31.11 
 
 
579 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  30.25 
 
 
525 aa  183  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  32.26 
 
 
523 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  30.47 
 
 
507 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  29.49 
 
 
554 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  28.54 
 
 
533 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  29.23 
 
 
525 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.87 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  29.37 
 
 
522 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.92 
 
 
553 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  30.05 
 
 
564 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  30.02 
 
 
590 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  28.36 
 
 
512 aa  178  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.43 
 
 
497 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  29.5 
 
 
546 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  27.01 
 
 
506 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  28.17 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  33.69 
 
 
506 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  31.81 
 
 
522 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  31.14 
 
 
543 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  30.65 
 
 
457 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  30.56 
 
 
491 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29.09 
 
 
495 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  27.23 
 
 
503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  32.23 
 
 
506 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  27.18 
 
 
539 aa  166  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  30.12 
 
 
559 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  27.57 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  26.77 
 
 
526 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  27.33 
 
 
520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  27.66 
 
 
523 aa  163  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  30.75 
 
 
493 aa  162  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30.04 
 
 
481 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  29.63 
 
 
453 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  28.1 
 
 
452 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30.08 
 
 
551 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  27.88 
 
 
501 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  32.49 
 
 
488 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  27.07 
 
 
526 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.7 
 
 
500 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  29.98 
 
 
487 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.66 
 
 
471 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>