More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5768 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6751  sulfatase  78.88 
 
 		 569 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  75.67 
 
 		 590 aa  822    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  71.15 
 
 		 561 aa  797    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  69.91 
 
 		 561 aa  777    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  77.26 
 
 		 569 aa  878    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  73.9 
 
 		 556 aa  802    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  89.93 
 
 		 556 aa  1030    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  100 
 
 		 555 aa  1146    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  87.03 
 
 		 554 aa  984    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  35.9 
 
 		 524 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  35.84 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  35.61 
 
 		 526 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  33.83 
 
 		 513 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  35.74 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  34.04 
 
 		 521 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  36.02 
 
 		 508 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  33.33 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  33.59 
 
 		 564 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  33.85 
 
 		 522 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  32.33 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  34.4 
 
 		 552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  33.73 
 
 		 557 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  32.54 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  34.36 
 
 		 505 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  33.98 
 
 		 505 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  33.86 
 
 		 522 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  32.11 
 
 		 512 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  33.15 
 
 		 545 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  33.33 
 
 		 522 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  34.26 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  33 
 
 		 544 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  34.24 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  33.14 
 
 		 552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  32.68 
 
 		 567 aa  220  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  34.06 
 
 		 496 aa  220  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  31.29 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  33.07 
 
 		 496 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  33.02 
 
 		 560 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  33.14 
 
 		 554 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  32.82 
 
 		 514 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  32.82 
 
 		 514 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  30.77 
 
 		 470 aa  216  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  32.29 
 
 		 542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.75 
 
 		 440 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  31.77 
 
 		 579 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  33.14 
 
 		 555 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  31.71 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  33.78 
 
 		 512 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  32.09 
 
 		 505 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.04 
 
 		 480 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.47 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  31.13 
 
 		 549 aa  197  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  30.67 
 
 		 548 aa  197  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  31.31 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  31.31 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  31.31 
 
 		 551 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  29.25 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.55 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  30.71 
 
 		 551 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  30.71 
 
 		 551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  30.06 
 
 		 550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  29.9 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  32.27 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  30.64 
 
 		 525 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  30.38 
 
 		 496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  31.93 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  29.51 
 
 		 503 aa  174  5.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.68 
 
 		 452 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.41 
 
 		 543 aa  170  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  30.99 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  30.29 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  31.97 
 
 		 458 aa  163  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.18 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.59 
 
 		 553 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  29.04 
 
 		 526 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  29.51 
 
 		 523 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  32.31 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29.71 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  29.98 
 
 		 487 aa  159  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  30.91 
 
 		 491 aa  156  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  29.31 
 
 		 506 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  29.33 
 
 		 526 aa  154  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.84 
 
 		 501 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.86 
 
 		 482 aa  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  29.01 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  30.29 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  31.46 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  31.46 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  30.1 
 
 		 457 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  31.31 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  31.31 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  29.24 
 
 		 522 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.23 
 
 		 497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  29.22 
 
 		 507 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  28.72 
 
 		 472 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  29.47 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.11 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.63 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.53 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  27.8 
 
 		 462 aa  143  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>