More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5416 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  84.34 
 
 		 567 aa  981    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  63.27 
 
 		 496 aa  649    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  70.71 
 
 		 560 aa  754    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  68.8 
 
 		 526 aa  699    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  100 
 
 		 579 aa  1206    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  66.6 
 
 		 557 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  65.04 
 
 		 515 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  73.78 
 
 		 544 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  67.08 
 
 		 552 aa  700    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  76.75 
 
 		 522 aa  824    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  58.81 
 
 		 547 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  59.21 
 
 		 512 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  58.53 
 
 		 514 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  58.53 
 
 		 514 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  61.15 
 
 		 496 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  59.79 
 
 		 525 aa  605  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  58.2 
 
 		 505 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  57.29 
 
 		 533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  58.66 
 
 		 512 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  60.13 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  57.64 
 
 		 548 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  56.6 
 
 		 549 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  55.99 
 
 		 555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  54.94 
 
 		 554 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  58.33 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  57.71 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  54.88 
 
 		 545 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  57.81 
 
 		 508 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  54.94 
 
 		 525 aa  544  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  54.64 
 
 		 513 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  52.73 
 
 		 521 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  54.82 
 
 		 522 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  54.08 
 
 		 522 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  53.47 
 
 		 552 aa  505  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  45.4 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  45.91 
 
 		 564 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  44.96 
 
 		 510 aa  434  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  43.5 
 
 		 546 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  41.75 
 
 		 512 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  42.21 
 
 		 542 aa  389  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  42.69 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  32.72 
 
 		 556 aa  223  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  32.36 
 
 		 569 aa  217  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  31.84 
 
 		 569 aa  213  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  32.04 
 
 		 554 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  32.5 
 
 		 556 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.55 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  31.05 
 
 		 590 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  32.63 
 
 		 561 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  32.83 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  31.66 
 
 		 496 aa  205  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  30.08 
 
 		 524 aa  203  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  31.18 
 
 		 555 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  31.59 
 
 		 561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  30.27 
 
 		 470 aa  198  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.9 
 
 		 480 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  30.89 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  31.11 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  30.41 
 
 		 551 aa  184  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  30.41 
 
 		 551 aa  184  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  30.41 
 
 		 551 aa  184  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  30.69 
 
 		 551 aa  183  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.58 
 
 		 466 aa  180  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  32 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  28.51 
 
 		 550 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  30.14 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.76 
 
 		 471 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  29.73 
 
 		 458 aa  159  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.27 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  31.02 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.38 
 
 		 482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.81 
 
 		 497 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  27.94 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.85 
 
 		 440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.72 
 
 		 497 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.11 
 
 		 501 aa  147  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  29.41 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.74 
 
 		 486 aa  146  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  27.23 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  33.24 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.83 
 
 		 638 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.12 
 
 		 497 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.12 
 
 		 497 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.12 
 
 		 497 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.12 
 
 		 497 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  31.89 
 
 		 497 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.91 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  27.07 
 
 		 472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  28.63 
 
 		 526 aa  138  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.59 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  27.88 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  27.59 
 
 		 543 aa  136  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  29.23 
 
 		 470 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  28.07 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  28.99 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  27.5 
 
 		 491 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  28.84 
 
 		 507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  26.04 
 
 		 465 aa  133  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.93 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  28.82 
 
 		 536 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>