More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0660 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  100 
 
 
525 aa  1094    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  63.95 
 
 
502 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  62.45 
 
 
515 aa  634  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  59.3 
 
 
512 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  59.79 
 
 
579 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  59.8 
 
 
557 aa  601  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  58.49 
 
 
496 aa  597  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  60.12 
 
 
496 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  59.92 
 
 
522 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  58.35 
 
 
526 aa  590  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  58.56 
 
 
567 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  58.56 
 
 
552 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  55.11 
 
 
533 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  56.52 
 
 
547 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  57.56 
 
 
545 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  57.63 
 
 
554 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  57.11 
 
 
521 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  57.4 
 
 
522 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  55.9 
 
 
548 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  57.77 
 
 
512 aa  565  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  56.2 
 
 
514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  54.73 
 
 
549 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  56.2 
 
 
514 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  55.08 
 
 
508 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  55.86 
 
 
560 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  55.96 
 
 
505 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  56.91 
 
 
544 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  58.76 
 
 
522 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  53.46 
 
 
505 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  53.66 
 
 
505 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  52.05 
 
 
513 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  51.15 
 
 
525 aa  534  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  58.92 
 
 
552 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  51.07 
 
 
555 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  49.81 
 
 
508 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  48.38 
 
 
510 aa  480  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  50.59 
 
 
564 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  42.75 
 
 
542 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  43.85 
 
 
546 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  42.23 
 
 
517 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  43.5 
 
 
512 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  32.63 
 
 
561 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  33.46 
 
 
590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  33.53 
 
 
569 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  33 
 
 
556 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  31.12 
 
 
555 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  32.11 
 
 
561 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  35.01 
 
 
462 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  33.13 
 
 
569 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  32.8 
 
 
554 aa  207  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  34.22 
 
 
480 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  31.07 
 
 
556 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  32.57 
 
 
486 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  33.83 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.26 
 
 
466 aa  196  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  35.48 
 
 
524 aa  193  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  31.81 
 
 
551 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  31.81 
 
 
551 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  29.37 
 
 
470 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  31.81 
 
 
551 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  31.57 
 
 
551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  31.57 
 
 
551 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  29.23 
 
 
440 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  27.98 
 
 
496 aa  179  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.16 
 
 
506 aa  173  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  33.17 
 
 
482 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  33.18 
 
 
487 aa  167  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  28.83 
 
 
452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  30.26 
 
 
522 aa  163  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  28.25 
 
 
471 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.51 
 
 
500 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.78 
 
 
457 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  31.46 
 
 
440 aa  155  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  30 
 
 
550 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.08 
 
 
553 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  29.38 
 
 
543 aa  150  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.47 
 
 
497 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.98 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  30.79 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  31.55 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  32.01 
 
 
486 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.5 
 
 
497 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.5 
 
 
497 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  28.15 
 
 
548 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.14 
 
 
470 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  29.68 
 
 
479 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.44 
 
 
497 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.44 
 
 
497 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  29.74 
 
 
453 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  30.73 
 
 
638 aa  144  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  32.17 
 
 
462 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  26.4 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.19 
 
 
497 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  31.64 
 
 
471 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  27.12 
 
 
510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  27.33 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.15 
 
 
491 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  29.65 
 
 
442 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  28.14 
 
 
467 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  27.61 
 
 
440 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>