More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0357 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  71.4 
 
 
517 aa  784    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  100 
 
 
512 aa  1063    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  45.11 
 
 
564 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  46.06 
 
 
513 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  46.18 
 
 
508 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  44.23 
 
 
546 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  43.55 
 
 
545 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  45.28 
 
 
505 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  44.88 
 
 
505 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  43.74 
 
 
554 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  45.1 
 
 
526 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  44.02 
 
 
552 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  44.44 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  43.94 
 
 
512 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  41.25 
 
 
557 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  43.55 
 
 
522 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  43.23 
 
 
515 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  43.03 
 
 
547 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  41.44 
 
 
555 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  42.02 
 
 
496 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  42.51 
 
 
548 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  43.5 
 
 
525 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  41.55 
 
 
512 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  42.65 
 
 
502 aa  391  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  41.75 
 
 
579 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  42.71 
 
 
514 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  42.71 
 
 
514 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  43.37 
 
 
521 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  43.41 
 
 
544 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  42.65 
 
 
505 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  41.96 
 
 
567 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  41.57 
 
 
549 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  42.2 
 
 
522 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  40.54 
 
 
508 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  39.51 
 
 
533 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  40.95 
 
 
522 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  42.5 
 
 
552 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  39.85 
 
 
525 aa  362  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  41.35 
 
 
560 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  42.5 
 
 
510 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  37.48 
 
 
542 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  32.53 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  31.74 
 
 
590 aa  210  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  31.71 
 
 
555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  30.9 
 
 
556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  31.1 
 
 
569 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  31.24 
 
 
561 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  31.74 
 
 
561 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  32.18 
 
 
554 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  30.49 
 
 
524 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  30.48 
 
 
569 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  32.18 
 
 
486 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  27.88 
 
 
470 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.4 
 
 
480 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  28.36 
 
 
440 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.16 
 
 
458 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  28.34 
 
 
550 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  30.12 
 
 
462 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  29.45 
 
 
551 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  29.45 
 
 
551 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  28.99 
 
 
551 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  28.99 
 
 
551 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  28.99 
 
 
551 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  31.2 
 
 
497 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.1 
 
 
466 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.47 
 
 
497 aa  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.21 
 
 
497 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.21 
 
 
497 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.21 
 
 
497 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.8 
 
 
497 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.05 
 
 
506 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  26.83 
 
 
452 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  28.6 
 
 
496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30 
 
 
472 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.76 
 
 
482 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  26.81 
 
 
479 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.12 
 
 
470 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
457 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.87 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.95 
 
 
501 aa  140  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.48 
 
 
486 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  28.92 
 
 
462 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  25.22 
 
 
471 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29.07 
 
 
500 aa  136  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  28.44 
 
 
487 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  28.28 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.97 
 
 
491 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  26.74 
 
 
453 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  28.3 
 
 
506 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.48 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  25.95 
 
 
543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  26.99 
 
 
440 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  26.35 
 
 
539 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  25.79 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.26 
 
 
491 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  27.97 
 
 
453 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  27.23 
 
 
493 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  27.16 
 
 
522 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  27.73 
 
 
495 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  26.68 
 
 
507 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>