More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2166 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  62.85 
 
 		 523 aa  634    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  100 
 
 		 497 aa  1036    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  51.85 
 
 		 481 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  47.72 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  44.47 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  44.81 
 
 		 500 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  45.82 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  44.2 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  41.43 
 
 		 536 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  39.67 
 
 		 500 aa  343  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  38.38 
 
 		 488 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  38.03 
 
 		 460 aa  306  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  36.84 
 
 		 457 aa  273  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  35.66 
 
 		 462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  34.72 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  31.94 
 
 		 471 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  33.2 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.07 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  33.48 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  32.39 
 
 		 497 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  31.33 
 
 		 452 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  31.98 
 
 		 470 aa  226  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  32.71 
 
 		 497 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  32.71 
 
 		 497 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  34 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.61 
 
 		 539 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  32.52 
 
 		 497 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  32.33 
 
 		 497 aa  220  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.09 
 
 		 453 aa  219  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  32.4 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  32.46 
 
 		 487 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  31.08 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  31.74 
 
 		 497 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  33.47 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.69 
 
 		 480 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  31.92 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  31.62 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  34.69 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  31.97 
 
 		 584 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  31.32 
 
 		 719 aa  204  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  32.32 
 
 		 551 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  31.21 
 
 		 471 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  30.25 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.93 
 
 		 495 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0953  sulfatase  30.02 
 
 		 1414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.462358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  31.83 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  32.23 
 
 		 470 aa  195  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.38 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  29.41 
 
 		 472 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  30.99 
 
 		 616 aa  193  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.6 
 
 		 506 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  30.1 
 
 		 520 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  29.25 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  32.31 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  29.46 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  30.25 
 
 		 542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.06 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  32.1 
 
 		 523 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  28.98 
 
 		 506 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  31.77 
 
 		 457 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  31.12 
 
 		 490 aa  190  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  30.54 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  30.08 
 
 		 520 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  31.94 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  29.84 
 
 		 551 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  31.03 
 
 		 556 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  30.27 
 
 		 582 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  32.59 
 
 		 631 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  30.36 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  30.42 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  29.96 
 
 		 507 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  29.36 
 
 		 554 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  29.71 
 
 		 534 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  29.64 
 
 		 493 aa  182  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  29.14 
 
 		 467 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  29.78 
 
 		 555 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  30.65 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  30.79 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  31.73 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  29.5 
 
 		 563 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  27.72 
 
 		 522 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  29.98 
 
 		 571 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  28.23 
 
 		 637 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  30.72 
 
 		 442 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.4 
 
 		 519 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  29.82 
 
 		 503 aa  176  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  29.5 
 
 		 526 aa  176  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  31.43 
 
 		 440 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  27.99 
 
 		 533 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.3 
 
 		 638 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  30.53 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  28.39 
 
 		 609 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  30.04 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  29.28 
 
 		 778 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  30.6 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.05 
 
 		 491 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  31.2 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  28.57 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  27.9 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  28.18 
 
 		 559 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>