More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3373 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  100 
 
 
481 aa  994    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  50.41 
 
 
497 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  48.34 
 
 
523 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  44.85 
 
 
500 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  43.31 
 
 
468 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  43.3 
 
 
481 aa  365  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  42.44 
 
 
474 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  41.01 
 
 
500 aa  334  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  40.48 
 
 
480 aa  333  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  37.88 
 
 
536 aa  315  8e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  35.84 
 
 
460 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  38.48 
 
 
488 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  36.29 
 
 
457 aa  256  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  32.69 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  32.21 
 
 
452 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  31.06 
 
 
458 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  32.71 
 
 
486 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.75 
 
 
462 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  34.03 
 
 
491 aa  203  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  33.03 
 
 
470 aa  202  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  32.56 
 
 
487 aa  202  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  32.57 
 
 
551 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  32.05 
 
 
440 aa  200  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0451  sulfatase  29.15 
 
 
719 aa  199  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  31.97 
 
 
471 aa  197  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.7 
 
 
539 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  32.17 
 
 
553 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.84 
 
 
472 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0953  sulfatase  29.87 
 
 
1414 aa  193  6e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.462358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.53 
 
 
457 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  33.99 
 
 
470 aa  192  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  32.99 
 
 
631 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  32.63 
 
 
466 aa  190  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  30.71 
 
 
503 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.99 
 
 
497 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  33.11 
 
 
482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  30.12 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  29.46 
 
 
467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.13 
 
 
500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  31.61 
 
 
471 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  30.06 
 
 
453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.57 
 
 
506 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.1 
 
 
453 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  29.57 
 
 
490 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.08 
 
 
501 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  29.44 
 
 
462 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  30.44 
 
 
497 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  32.51 
 
 
491 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  30.53 
 
 
497 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  30.77 
 
 
497 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  30.77 
 
 
497 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.87 
 
 
480 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  28.93 
 
 
517 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  28.79 
 
 
637 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  28.63 
 
 
559 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  31.37 
 
 
503 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  28.89 
 
 
543 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  29.48 
 
 
484 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.66 
 
 
497 aa  170  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  32.58 
 
 
438 aa  170  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  31.18 
 
 
457 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  30.24 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.2 
 
 
495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  30.04 
 
 
542 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  30.63 
 
 
523 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  29.13 
 
 
520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  28.57 
 
 
526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.26 
 
 
553 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.15 
 
 
543 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  27.38 
 
 
520 aa  163  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  28.83 
 
 
506 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  31.9 
 
 
453 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  29.14 
 
 
507 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.77 
 
 
486 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  31.32 
 
 
492 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  30.54 
 
 
493 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  28.45 
 
 
489 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  27.93 
 
 
519 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  29.41 
 
 
510 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  31.59 
 
 
442 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  29.8 
 
 
442 aa  156  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  29.03 
 
 
627 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  28.15 
 
 
522 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  28.95 
 
 
523 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  27.57 
 
 
638 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.99 
 
 
533 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  27.08 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  29.35 
 
 
526 aa  154  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.03 
 
 
548 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  27.35 
 
 
558 aa  154  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.75 
 
 
482 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  27.49 
 
 
478 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  28.57 
 
 
523 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.16 
 
 
440 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  29.04 
 
 
563 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  28.17 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  27.79 
 
 
517 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  29.29 
 
 
542 aa  146  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  28.27 
 
 
489 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  28.15 
 
 
534 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>