More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1638 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  100 
 
 
457 aa  944    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  40.26 
 
 
481 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  38.46 
 
 
488 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  37.27 
 
 
480 aa  298  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  38.46 
 
 
474 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  36.93 
 
 
468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  35.42 
 
 
523 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  36.84 
 
 
497 aa  273  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  36.63 
 
 
460 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  36.72 
 
 
481 aa  250  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  33.66 
 
 
500 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  32.41 
 
 
553 aa  220  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  34 
 
 
453 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  33.56 
 
 
487 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  29.49 
 
 
536 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  31.31 
 
 
500 aa  210  3e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  31.19 
 
 
457 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  31.51 
 
 
465 aa  204  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  32.75 
 
 
452 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.4 
 
 
506 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  32.53 
 
 
500 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  33.33 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  31.9 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.43 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  31.56 
 
 
472 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  32.74 
 
 
453 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  32.51 
 
 
489 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.61 
 
 
486 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  30.77 
 
 
462 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  34.07 
 
 
631 aa  193  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  29.39 
 
 
440 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  30.66 
 
 
442 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.75 
 
 
480 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  32.89 
 
 
491 aa  193  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  29.71 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  29.09 
 
 
551 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  30.34 
 
 
471 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  31.47 
 
 
482 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  29.96 
 
 
627 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  31.18 
 
 
462 aa  183  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  28.45 
 
 
581 aa  182  8.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  30.94 
 
 
457 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  31.24 
 
 
517 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  30.77 
 
 
484 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.54 
 
 
543 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  31.07 
 
 
442 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  30.27 
 
 
438 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.8 
 
 
458 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  31.19 
 
 
510 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  29.51 
 
 
551 aa  177  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  29.42 
 
 
539 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  30.49 
 
 
517 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  29.95 
 
 
490 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  30.44 
 
 
467 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  30.37 
 
 
482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  31.97 
 
 
497 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  31.46 
 
 
497 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  31.87 
 
 
497 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  31.6 
 
 
497 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  31.02 
 
 
497 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  30.08 
 
 
470 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  27.52 
 
 
563 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  27.9 
 
 
495 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  28.89 
 
 
553 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  31.74 
 
 
501 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  29.07 
 
 
471 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  28.05 
 
 
582 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  28.21 
 
 
522 aa  166  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  31.88 
 
 
497 aa  166  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  28.47 
 
 
536 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  28.9 
 
 
596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  29.32 
 
 
609 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  30.06 
 
 
559 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  30.04 
 
 
543 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.6 
 
 
533 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  29.49 
 
 
453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  27.93 
 
 
554 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  26.31 
 
 
541 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  27.37 
 
 
519 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  28.33 
 
 
486 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  28.08 
 
 
584 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  27.8 
 
 
536 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  27.08 
 
 
637 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  28.98 
 
 
548 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  27.83 
 
 
536 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  28.02 
 
 
534 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.29 
 
 
556 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  30.26 
 
 
492 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  28.22 
 
 
563 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  29.04 
 
 
554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  29.13 
 
 
562 aa  156  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  25.58 
 
 
542 aa  156  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0381  sulfatase  28.15 
 
 
778 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  29.44 
 
 
513 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  27.89 
 
 
491 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  27.37 
 
 
555 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  28.82 
 
 
489 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  25.49 
 
 
571 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  29.41 
 
 
440 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  29.17 
 
 
560 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>