More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3980 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  100 
 
 
458 aa  932    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  42.67 
 
 
486 aa  340  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  41.01 
 
 
462 aa  329  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  40.09 
 
 
480 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  40.52 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  43.85 
 
 
466 aa  317  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  41 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  37.5 
 
 
470 aa  257  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  35.99 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  36.17 
 
 
479 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  35.89 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  35.62 
 
 
452 aa  223  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  36.34 
 
 
440 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  33.47 
 
 
497 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  34.37 
 
 
517 aa  219  7e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  35.75 
 
 
453 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  34.77 
 
 
478 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  34.48 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  38.57 
 
 
491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  34.67 
 
 
493 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 
457 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  36.32 
 
 
470 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  37.8 
 
 
462 aa  210  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  31.5 
 
 
481 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  34.88 
 
 
553 aa  210  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  33.49 
 
 
467 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  36.28 
 
 
543 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  34.19 
 
 
508 aa  207  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  34.69 
 
 
471 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  33.83 
 
 
525 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  32.26 
 
 
500 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.52 
 
 
539 aa  206  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  35.61 
 
 
487 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  37.77 
 
 
482 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  35.4 
 
 
510 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  34.17 
 
 
474 aa  202  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  35.36 
 
 
491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  33.26 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  32.6 
 
 
470 aa  201  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  31.84 
 
 
497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  33.18 
 
 
481 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  34.5 
 
 
631 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.82 
 
 
501 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  29.91 
 
 
513 aa  199  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  34.91 
 
 
465 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  31.67 
 
 
497 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  29.7 
 
 
542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  31.84 
 
 
497 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  31.08 
 
 
506 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  31.84 
 
 
497 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  33.03 
 
 
453 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  31.84 
 
 
497 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  32.34 
 
 
495 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  31.84 
 
 
497 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  33.04 
 
 
489 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  30.58 
 
 
533 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  31.25 
 
 
523 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  34.71 
 
 
442 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  30.86 
 
 
496 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  29.72 
 
 
520 aa  192  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  32.87 
 
 
546 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  30.54 
 
 
503 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  33.95 
 
 
490 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  34.62 
 
 
486 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  29.23 
 
 
581 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  31.88 
 
 
480 aa  188  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  29.01 
 
 
523 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  34.96 
 
 
453 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  32.44 
 
 
496 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  32.69 
 
 
564 aa  187  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  31.69 
 
 
460 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  32.8 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  28.75 
 
 
520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  30.27 
 
 
526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  30.66 
 
 
547 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  31.14 
 
 
500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  30.28 
 
 
492 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  31.91 
 
 
508 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  30.61 
 
 
512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  30.31 
 
 
517 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  30.32 
 
 
522 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  32 
 
 
521 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  31.5 
 
 
552 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  28.51 
 
 
503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  30.62 
 
 
545 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  29.55 
 
 
515 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  30.62 
 
 
500 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  31.07 
 
 
522 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  30.69 
 
 
502 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  30.07 
 
 
512 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  34.79 
 
 
457 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  30.25 
 
 
523 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  30.11 
 
 
557 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  30.91 
 
 
554 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  29.71 
 
 
552 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  34.77 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  32.99 
 
 
496 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  29.63 
 
 
514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  34.69 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  30.33 
 
 
637 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>