More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1131 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  100 
 
 		 551 aa  1133    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  56.58 
 
 		 559 aa  617  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  51.89 
 
 		 553 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  49.45 
 
 		 543 aa  528  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  45.01 
 
 		 548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  38.8 
 
 		 539 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  35.11 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  34.88 
 
 		 479 aa  270  5e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  33.19 
 
 		 500 aa  269  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  34.26 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  33.12 
 
 		 487 aa  256  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  35.31 
 
 		 472 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  33.26 
 
 		 467 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  34.94 
 
 		 465 aa  246  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  32.44 
 
 		 462 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  31.35 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  32.77 
 
 		 440 aa  224  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  32.77 
 
 		 442 aa  220  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  32.97 
 
 		 491 aa  220  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  32.18 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.22 
 
 		 470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  30.21 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  31.26 
 
 		 491 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  31.53 
 
 		 492 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  34.71 
 
 		 466 aa  209  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  31.08 
 
 		 517 aa  209  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  30.36 
 
 		 490 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  30.77 
 
 		 510 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  32.19 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  30.64 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  31.2 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  30.95 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.11 
 
 		 452 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.37 
 
 		 497 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  31.72 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  30.21 
 
 		 488 aa  196  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  30.29 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  30.33 
 
 		 481 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  29.8 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  29.96 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  29.38 
 
 		 460 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  29.71 
 
 		 457 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  30.92 
 
 		 558 aa  187  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.27 
 
 		 523 aa  186  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  28.42 
 
 		 486 aa  186  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  30.39 
 
 		 631 aa  186  8e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  29.25 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  29.68 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.16 
 
 		 533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.72 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  27.5 
 
 		 553 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  29 
 
 		 440 aa  181  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  29.38 
 
 		 637 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  28.08 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.94 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  30.04 
 
 		 724 aa  178  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  27.9 
 
 		 520 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.52 
 
 		 506 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.07 
 
 		 458 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  28.98 
 
 		 560 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  29.2 
 
 		 560 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  28.98 
 
 		 560 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  29.4 
 
 		 486 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.34 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.04 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  28.98 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  28.98 
 
 		 560 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  28.98 
 
 		 539 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  28.74 
 
 		 478 aa  173  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  31.07 
 
 		 507 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  27.78 
 
 		 489 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.22 
 
 		 480 aa  170  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  30.19 
 
 		 519 aa  169  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.92 
 
 		 497 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  28.24 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  28.24 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  28.24 
 
 		 535 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.66 
 
 		 497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.66 
 
 		 497 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.66 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.66 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  27.71 
 
 		 542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  27.27 
 
 		 562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  29.3 
 
 		 470 aa  164  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  27.27 
 
 		 584 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  26.5 
 
 		 543 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  30.04 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  28.57 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  28.02 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  27.72 
 
 		 480 aa  160  7e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  26.11 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  27.97 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  26.57 
 
 		 627 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  26.45 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  28.22 
 
 		 534 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1378  sulfatase  28.22 
 
 		 557 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  28.26 
 
 		 524 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3148  sulfatase  28.22 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  27.55 
 
 		 483 aa  157  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>