More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3651 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  100 
 
 
483 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  38.34 
 
 
534 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1378  sulfatase  38.34 
 
 
557 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3148  sulfatase  38.34 
 
 
534 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  37.45 
 
 
560 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  37.45 
 
 
560 aa  306  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  37.25 
 
 
560 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  37.25 
 
 
560 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  37.25 
 
 
560 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  37.25 
 
 
539 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  33.08 
 
 
535 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  33.08 
 
 
535 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  33.08 
 
 
535 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  32.82 
 
 
487 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  31.77 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.43 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  30.83 
 
 
471 aa  219  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  31.45 
 
 
467 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  31.96 
 
 
500 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  31.97 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.22 
 
 
472 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  33 
 
 
465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  31.36 
 
 
440 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  30.99 
 
 
453 aa  190  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  30 
 
 
470 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  29.24 
 
 
462 aa  187  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  30.36 
 
 
478 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  29.34 
 
 
517 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  28.04 
 
 
539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  29.61 
 
 
492 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.47 
 
 
553 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.46 
 
 
452 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.96 
 
 
501 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  28.93 
 
 
490 aa  176  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  30.2 
 
 
486 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  28.77 
 
 
627 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  29.98 
 
 
495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  29.76 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  30.36 
 
 
442 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  29.76 
 
 
491 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  26.5 
 
 
553 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  30.1 
 
 
497 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.82 
 
 
497 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  30.43 
 
 
631 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.9 
 
 
497 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  30.39 
 
 
638 aa  169  7e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.9 
 
 
497 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.9 
 
 
497 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  30.1 
 
 
482 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.16 
 
 
497 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  28.54 
 
 
482 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  28.63 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.41 
 
 
458 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  27.48 
 
 
484 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  29.14 
 
 
457 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  28.32 
 
 
510 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  27.93 
 
 
558 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0390  sulfatase  28.15 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334066  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  28.39 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  28.48 
 
 
551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  28.32 
 
 
489 aa  163  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  27.46 
 
 
460 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  25.57 
 
 
533 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.9 
 
 
480 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.24 
 
 
491 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  25.79 
 
 
581 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  28.81 
 
 
442 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.84 
 
 
497 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  28.57 
 
 
486 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  27.49 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  27.15 
 
 
480 aa  156  7e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  25.83 
 
 
551 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  25.17 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  25.86 
 
 
480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  27.66 
 
 
468 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  28.63 
 
 
517 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  27.42 
 
 
519 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  27.92 
 
 
559 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  27.5 
 
 
453 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  27.68 
 
 
459 aa  151  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  26.24 
 
 
543 aa  151  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  28.96 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.2 
 
 
474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  26.24 
 
 
542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  26.72 
 
 
489 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  27.86 
 
 
772 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  26.93 
 
 
453 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  25.39 
 
 
571 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  26.71 
 
 
493 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.81 
 
 
440 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  28.02 
 
 
506 aa  143  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  27.44 
 
 
497 aa  143  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  26.81 
 
 
554 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.53 
 
 
488 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  27.83 
 
 
536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  25.6 
 
 
548 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  24.42 
 
 
523 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  25.05 
 
 
564 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  25.24 
 
 
489 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  25.49 
 
 
562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>