More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1263 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  81.94 
 
 
560 aa  915    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  82.32 
 
 
560 aa  918    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  82.13 
 
 
560 aa  917    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  82.13 
 
 
539 aa  914    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  82.13 
 
 
560 aa  917    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  100 
 
 
534 aa  1110    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  81.94 
 
 
560 aa  915    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3148  sulfatase  99.81 
 
 
534 aa  1107    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1378  sulfatase  100 
 
 
557 aa  1112    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  39.8 
 
 
535 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  39.8 
 
 
535 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  39.8 
 
 
535 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  38.34 
 
 
483 aa  299  9e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29.63 
 
 
500 aa  190  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  27.33 
 
 
487 aa  190  5e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29.78 
 
 
470 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  27.65 
 
 
467 aa  180  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.96 
 
 
479 aa  174  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  28.92 
 
 
465 aa  167  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.88 
 
 
471 aa  163  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  27.91 
 
 
472 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  26.53 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  28.22 
 
 
551 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.15 
 
 
457 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  25.39 
 
 
559 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.45 
 
 
453 aa  144  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  27.07 
 
 
482 aa  144  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.51 
 
 
491 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  26.37 
 
 
519 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  26.46 
 
 
627 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  28.15 
 
 
442 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  28.74 
 
 
438 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  26.37 
 
 
497 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  25.55 
 
 
563 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  25.65 
 
 
510 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  26.55 
 
 
468 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  23.76 
 
 
452 aa  136  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  25 
 
 
484 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  26.87 
 
 
480 aa  134  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  24.61 
 
 
490 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.27 
 
 
501 aa  133  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  24.56 
 
 
495 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  25.53 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.15 
 
 
506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  27.42 
 
 
481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  26.49 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  26.01 
 
 
548 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  24.52 
 
 
539 aa  130  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  27.42 
 
 
543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  27.36 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  28.68 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  24.2 
 
 
462 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  28.72 
 
 
466 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  27.29 
 
 
489 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  25.38 
 
 
517 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  25.75 
 
 
517 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  24.9 
 
 
638 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  25.85 
 
 
637 aa  124  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  27.22 
 
 
497 aa  124  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  28.76 
 
 
486 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  26.49 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  26.48 
 
 
631 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  26.08 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  27.96 
 
 
442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  25.9 
 
 
491 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  26.77 
 
 
523 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  27.44 
 
 
492 aa  120  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  26.95 
 
 
551 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  26.25 
 
 
550 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  25.43 
 
 
478 aa  120  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  26.88 
 
 
462 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  24.88 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  26.48 
 
 
488 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  28.57 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.56 
 
 
553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  26.7 
 
 
551 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  23.83 
 
 
440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  24.95 
 
 
500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  26.7 
 
 
551 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3832  sulfatase  24.75 
 
 
784 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  26.7 
 
 
551 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  26.7 
 
 
551 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  26.2 
 
 
457 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  23.37 
 
 
553 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  24.71 
 
 
555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  23.16 
 
 
542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  27.74 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  28.44 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.9 
 
 
497 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.96 
 
 
497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.96 
 
 
497 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  26.97 
 
 
558 aa  114  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.96 
 
 
497 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.96 
 
 
497 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  25.12 
 
 
440 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  24.05 
 
 
554 aa  114  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  26.32 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2363  sulfatase  24.49 
 
 
783 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  27.48 
 
 
453 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  26.39 
 
 
478 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>