More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6289 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  74.18 
 
 
462 aa  727    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  100 
 
 
486 aa  1000    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  52.97 
 
 
480 aa  498  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  44.99 
 
 
506 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  44.44 
 
 
466 aa  339  5e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  42.67 
 
 
458 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  37.89 
 
 
440 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  38.98 
 
 
440 aa  253  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  36.49 
 
 
470 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  36.1 
 
 
510 aa  242  1e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  37.26 
 
 
440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0354  sulfatase  32.7 
 
 
493 aa  234  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  35.65 
 
 
547 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  32.98 
 
 
470 aa  233  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  33.07 
 
 
497 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  33.71 
 
 
452 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  32.23 
 
 
472 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  33.92 
 
 
457 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  33.62 
 
 
479 aa  226  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  32.89 
 
 
503 aa  226  9e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  34 
 
 
453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  32.68 
 
 
471 aa  223  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  31.59 
 
 
520 aa  222  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  33.18 
 
 
552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  33.47 
 
 
506 aa  222  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  31.95 
 
 
520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  33.6 
 
 
481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  33.26 
 
 
508 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  34.52 
 
 
496 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  36.34 
 
 
496 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  32.31 
 
 
474 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  33.55 
 
 
557 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  33.47 
 
 
503 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  31.68 
 
 
542 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  33.26 
 
 
505 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  33.49 
 
 
505 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  33.54 
 
 
523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  31.02 
 
 
507 aa  213  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  32.82 
 
 
526 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  33.26 
 
 
500 aa  213  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  34.11 
 
 
508 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  32.02 
 
 
523 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  35.01 
 
 
552 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  32.83 
 
 
544 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1842  sulfatase  31.52 
 
 
526 aa  211  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  32.72 
 
 
546 aa  210  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  34.51 
 
 
491 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  34.08 
 
 
496 aa  210  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  33.77 
 
 
453 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  32.59 
 
 
522 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  32.33 
 
 
526 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  30.33 
 
 
539 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  32.67 
 
 
482 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  34.89 
 
 
521 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3660  sulfatase  31.89 
 
 
523 aa  206  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000523129  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.63 
 
 
470 aa  206  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  30.84 
 
 
517 aa  205  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  31.63 
 
 
513 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  33.19 
 
 
481 aa  205  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  31.67 
 
 
567 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  32.89 
 
 
579 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  32.23 
 
 
500 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  33.92 
 
 
487 aa  203  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  33.63 
 
 
491 aa  203  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  30.52 
 
 
468 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  33.58 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  32.62 
 
 
560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  30.61 
 
 
555 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  34.42 
 
 
543 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  32.57 
 
 
525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  31.15 
 
 
512 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  31.42 
 
 
495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3913  sulfatase  31.04 
 
 
522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.656698  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.87 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0440  sulfatase  31.45 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0138449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  32.39 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  33.33 
 
 
512 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  31.38 
 
 
488 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  31.2 
 
 
553 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  33.49 
 
 
545 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  30.8 
 
 
523 aa  196  9e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  30.19 
 
 
467 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  31.67 
 
 
502 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  30.48 
 
 
517 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  32.36 
 
 
549 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  31.61 
 
 
457 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  32.21 
 
 
548 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  30.05 
 
 
486 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  34.84 
 
 
522 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  31.23 
 
 
489 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  30.99 
 
 
506 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  31.75 
 
 
471 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  31.52 
 
 
501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  31.28 
 
 
514 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  31.28 
 
 
514 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  31.31 
 
 
462 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  34 
 
 
556 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  31.59 
 
 
525 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  30.31 
 
 
559 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  31.81 
 
 
554 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>