More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0820 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  100 
 
 
627 aa  1315    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  37.21 
 
 
519 aa  296  8e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  32.85 
 
 
638 aa  222  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  31.32 
 
 
491 aa  206  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  29.66 
 
 
457 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  31.52 
 
 
495 aa  200  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  30.72 
 
 
479 aa  197  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  30.31 
 
 
453 aa  197  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  28.14 
 
 
490 aa  190  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  32.18 
 
 
501 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29.01 
 
 
500 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29.57 
 
 
470 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  29.96 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  30.12 
 
 
510 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  28.52 
 
 
554 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  26.98 
 
 
517 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  29.17 
 
 
534 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  29.31 
 
 
487 aa  181  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  30.89 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  29.92 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  30.37 
 
 
466 aa  174  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  30.41 
 
 
486 aa  174  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.68 
 
 
556 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.78 
 
 
497 aa  173  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.92 
 
 
497 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.46 
 
 
497 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.78 
 
 
497 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.78 
 
 
497 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.78 
 
 
497 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  27.2 
 
 
472 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  25.67 
 
 
471 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.26 
 
 
533 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  28.21 
 
 
555 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  28.49 
 
 
543 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  27.61 
 
 
462 aa  166  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  27.82 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  28.54 
 
 
578 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  27.26 
 
 
497 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0299  sulfatase  28.74 
 
 
609 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  27.77 
 
 
563 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  28 
 
 
483 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  26.96 
 
 
534 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  26.57 
 
 
541 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  28.65 
 
 
596 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  29.3 
 
 
536 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  28.32 
 
 
553 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.61 
 
 
482 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  27.38 
 
 
467 aa  158  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  26.49 
 
 
523 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  31.87 
 
 
460 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  29.03 
 
 
481 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  28.48 
 
 
558 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  26.33 
 
 
548 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  26.73 
 
 
489 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  27.03 
 
 
582 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  28.23 
 
 
462 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  27.15 
 
 
551 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  26.82 
 
 
482 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1841  sulfatase  27.34 
 
 
554 aa  153  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  28.8 
 
 
440 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  27.27 
 
 
536 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  28.42 
 
 
474 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  25.63 
 
 
616 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  27.27 
 
 
553 aa  152  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.34 
 
 
468 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  27.25 
 
 
480 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  26.27 
 
 
491 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  27.13 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  29.04 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  26.65 
 
 
543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  28.08 
 
 
500 aa  149  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  26.61 
 
 
584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  28.51 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  26.09 
 
 
458 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  27.52 
 
 
563 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.97 
 
 
488 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  26.17 
 
 
551 aa  147  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  25.62 
 
 
559 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  27.59 
 
 
442 aa  147  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  27.36 
 
 
536 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3371  arylsulfatase  26.58 
 
 
579 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.64108  normal  0.82619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3466  arylsulfatase  26.58 
 
 
579 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3297  arylsulfatase  26.58 
 
 
579 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.978245  normal  0.995381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  28.6 
 
 
453 aa  146  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3043  sulfatase  28.24 
 
 
560 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0150299  hitchhiker  0.0001034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  26.23 
 
 
506 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  27.13 
 
 
536 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  27.5 
 
 
523 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3364  arylsulfatase  26.39 
 
 
579 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244969  normal  0.949476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  25.9 
 
 
452 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  28.09 
 
 
457 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  27.14 
 
 
481 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3535  putative arylsulfatase  27.74 
 
 
759 aa  144  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.441448  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  26.68 
 
 
542 aa  142  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  26.09 
 
 
479 aa  141  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0841  arylsulfatase  26.9 
 
 
584 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  27.95 
 
 
442 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  27.05 
 
 
520 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  27.87 
 
 
631 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  26.46 
 
 
534 aa  140  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>