More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2379 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  100 
 
 
470 aa  976    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  42.35 
 
 
510 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  41.81 
 
 
478 aa  343  5e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  40.54 
 
 
492 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  40.29 
 
 
482 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  38.77 
 
 
631 aa  296  5e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  37.53 
 
 
517 aa  270  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  38.43 
 
 
490 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  35.4 
 
 
487 aa  246  8e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  32.8 
 
 
497 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  34.73 
 
 
453 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  35.46 
 
 
484 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  33.4 
 
 
452 aa  239  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  34.07 
 
 
471 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  34.19 
 
 
495 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  32.69 
 
 
472 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  31.99 
 
 
637 aa  223  4e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  34.23 
 
 
440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  31.91 
 
 
479 aa  222  9e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  36.12 
 
 
467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  32.99 
 
 
489 aa  220  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  34 
 
 
457 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  33.7 
 
 
466 aa  217  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  31.42 
 
 
491 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  30.84 
 
 
517 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  32.38 
 
 
522 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  31.26 
 
 
500 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  34.29 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.98 
 
 
548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  33.13 
 
 
506 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  30.81 
 
 
513 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  29.4 
 
 
554 aa  211  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  31.22 
 
 
551 aa  210  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  31.06 
 
 
543 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  32.43 
 
 
470 aa  206  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  32.49 
 
 
465 aa  206  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.63 
 
 
486 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  32.55 
 
 
497 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  32.55 
 
 
497 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  30.41 
 
 
501 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  34.51 
 
 
468 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  32.55 
 
 
497 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  32.55 
 
 
497 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  31.12 
 
 
497 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  31.14 
 
 
462 aa  203  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  33.82 
 
 
536 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.8 
 
 
553 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  32.6 
 
 
519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  31.35 
 
 
497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  29.82 
 
 
539 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  31.19 
 
 
553 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  31.71 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  34.19 
 
 
523 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.6 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  31.04 
 
 
481 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  31.89 
 
 
491 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  27.54 
 
 
562 aa  196  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  32.23 
 
 
497 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  31.12 
 
 
480 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  32.88 
 
 
482 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  31.2 
 
 
724 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  30.5 
 
 
578 aa  193  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  32.36 
 
 
582 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  33.99 
 
 
481 aa  192  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  30.71 
 
 
533 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2014  sulfatase  29.59 
 
 
596 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124362  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  32.19 
 
 
486 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  30.28 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  29.12 
 
 
766 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0870  sulfatase  29.94 
 
 
534 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.953668  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  32.08 
 
 
500 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  32.17 
 
 
488 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  30.21 
 
 
536 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  29.76 
 
 
559 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  32.57 
 
 
460 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.71 
 
 
543 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  29.72 
 
 
536 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  30.17 
 
 
556 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  29.53 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  31.3 
 
 
453 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  29.91 
 
 
541 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  31.05 
 
 
555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  30.24 
 
 
462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  30.22 
 
 
772 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  31.21 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  29.91 
 
 
453 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  32.11 
 
 
500 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  29.88 
 
 
480 aa  179  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  29.71 
 
 
584 aa  178  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  30.25 
 
 
551 aa  176  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  29.6 
 
 
554 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  30.89 
 
 
627 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2406  sulfatase  29.16 
 
 
534 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  31.96 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  32.66 
 
 
478 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  30.35 
 
 
542 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.08 
 
 
457 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  30 
 
 
483 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  30.66 
 
 
542 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  30.75 
 
 
457 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>