More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2148 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  99.46 
 
 
560 aa  1157    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  100 
 
 
560 aa  1161    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  99.64 
 
 
560 aa  1159    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  82.35 
 
 
534 aa  920    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  99.46 
 
 
560 aa  1157    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  99.81 
 
 
539 aa  1120    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1378  sulfatase  81.26 
 
 
557 aa  923    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3148  sulfatase  82.16 
 
 
534 aa  917    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  99.64 
 
 
560 aa  1159    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  39.25 
 
 
535 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  39.43 
 
 
535 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  39.25 
 
 
535 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  37.25 
 
 
483 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  33.63 
 
 
500 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  29.12 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.28 
 
 
470 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  27.89 
 
 
467 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.76 
 
 
479 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  29.34 
 
 
472 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.73 
 
 
465 aa  170  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  26.5 
 
 
539 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  29.2 
 
 
551 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  27.62 
 
 
470 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  26.67 
 
 
559 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  30.07 
 
 
471 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.73 
 
 
466 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  26.31 
 
 
484 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  26.5 
 
 
495 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  30.35 
 
 
442 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  25.76 
 
 
452 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.59 
 
 
453 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  30.35 
 
 
457 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  30.59 
 
 
438 aa  146  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  27.98 
 
 
482 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  26.36 
 
 
519 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  26.45 
 
 
510 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  27.76 
 
 
543 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  29.2 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  26.48 
 
 
548 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  27.14 
 
 
517 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  25.14 
 
 
553 aa  141  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  30.14 
 
 
492 aa  140  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  30.07 
 
 
497 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.27 
 
 
506 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  29.05 
 
 
442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  27.29 
 
 
478 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  26.65 
 
 
490 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  25.87 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  25.71 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  25.66 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  25.7 
 
 
497 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  25.7 
 
 
497 aa  134  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.84 
 
 
468 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  26.89 
 
 
551 aa  134  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  26.67 
 
 
551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  26.67 
 
 
551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  25.52 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  26.67 
 
 
551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  27.14 
 
 
550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  26.86 
 
 
551 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.14 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  25.51 
 
 
517 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  28.26 
 
 
489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  27.16 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.67 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  25.13 
 
 
497 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  25.84 
 
 
462 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  25.41 
 
 
474 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  26.01 
 
 
491 aa  127  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  25.8 
 
 
497 aa  127  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  25.68 
 
 
637 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  28.07 
 
 
480 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  25.64 
 
 
457 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  25.86 
 
 
480 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  24.48 
 
 
553 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  28.57 
 
 
486 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  28.22 
 
 
453 aa  123  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  29.57 
 
 
558 aa  123  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  26.91 
 
 
627 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  28.5 
 
 
488 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  26.86 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  26.1 
 
 
536 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  26.8 
 
 
631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  25.74 
 
 
497 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  27 
 
 
481 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  24.87 
 
 
571 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  24.27 
 
 
482 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  26.38 
 
 
462 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  28.15 
 
 
638 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  25 
 
 
500 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  26.02 
 
 
471 aa  118  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  24.18 
 
 
542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  26.08 
 
 
555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  31.03 
 
 
447 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  25.1 
 
 
772 aa  117  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  25.73 
 
 
554 aa  117  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  26.21 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  28.7 
 
 
459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  27.92 
 
 
460 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  24.46 
 
 
480 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>