More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0889 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  100 
 
 		 500 aa  1043    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  40.43 
 
 		 471 aa  307  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  37.14 
 
 		 487 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  35.03 
 
 		 495 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  34.68 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  34.37 
 
 		 465 aa  277  3e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  34.61 
 
 		 472 aa  269  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  37.39 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  33.12 
 
 		 470 aa  263  4e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  33.12 
 
 		 551 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  33.53 
 
 		 559 aa  256  8e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  33.62 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  34.33 
 
 		 467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  34.85 
 
 		 543 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  33.18 
 
 		 453 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  32.43 
 
 		 553 aa  246  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  32.81 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  31.66 
 
 		 539 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  33.2 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  31.1 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  31.72 
 
 		 457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  31.97 
 
 		 453 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  32.34 
 
 		 442 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  30.92 
 
 		 471 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  31.17 
 
 		 517 aa  221  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  31.24 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  30.43 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  33.04 
 
 		 481 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.01 
 
 		 506 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  30.17 
 
 		 486 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  31.01 
 
 		 510 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  34.72 
 
 		 548 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  30.98 
 
 		 478 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  33.12 
 
 		 492 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  29.02 
 
 		 533 aa  216  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  31.26 
 
 		 470 aa  216  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  28.97 
 
 		 491 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  30.77 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  29.09 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  29.7 
 
 		 542 aa  213  9e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  34.13 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  33.26 
 
 		 486 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  33.33 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  29.45 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  30.93 
 
 		 543 aa  209  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  30.02 
 
 		 489 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  33.85 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  33.85 
 
 		 560 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  33.85 
 
 		 560 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  33.85 
 
 		 560 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  33.85 
 
 		 539 aa  207  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  32.62 
 
 		 466 aa  206  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  33.63 
 
 		 560 aa  206  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  29.76 
 
 		 551 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  32.92 
 
 		 631 aa  205  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  28.75 
 
 		 501 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  31.12 
 
 		 482 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  28.81 
 
 		 536 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  30.85 
 
 		 490 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.93 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  30.49 
 
 		 558 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42934  arylsulfatase  30.64 
 
 		 564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.6 
 
 		 497 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  31.06 
 
 		 523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.79 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  31.96 
 
 		 483 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  32.53 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.26 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  31.58 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  30.55 
 
 		 638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.82 
 
 		 500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0491  sulfatase  29.12 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.244971 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  27.91 
 
 		 542 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  28.49 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1378  sulfatase  29.63 
 
 		 557 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01110  arylsulfatase A family protein  29.18 
 
 		 480 aa  191  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1263  sulfatase  29.63 
 
 		 534 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3148  sulfatase  29.24 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  29.91 
 
 		 484 aa  187  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  28.47 
 
 		 563 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  30.13 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.93 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.93 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.93 
 
 		 497 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  28.73 
 
 		 582 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.21 
 
 		 497 aa  183  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.72 
 
 		 497 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  31.35 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  28.63 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  28.85 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  28.63 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  28.63 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  32.33 
 
 		 459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  28.98 
 
 		 554 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  29.42 
 
 		 488 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  28.51 
 
 		 627 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  29.61 
 
 		 522 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  29.8 
 
 		 517 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2053  sulfatase  28.89 
 
 		 556 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.627693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  31.25 
 
 		 546 aa  176  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>