More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2408 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  100 
 
 
548 aa  1132    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  49.54 
 
 
553 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  44.83 
 
 
551 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  42.09 
 
 
559 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  45.75 
 
 
543 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  35.71 
 
 
539 aa  286  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  34.64 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  34.5 
 
 
487 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  33.33 
 
 
479 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  33.19 
 
 
517 aa  231  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  33.63 
 
 
471 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  32.89 
 
 
472 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 
457 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  34.72 
 
 
500 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  34.16 
 
 
466 aa  218  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  35.23 
 
 
440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  33.2 
 
 
492 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  29.98 
 
 
470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  31.33 
 
 
495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  31.59 
 
 
465 aa  208  2e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  32.9 
 
 
490 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  30.87 
 
 
470 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  30.06 
 
 
467 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  31.89 
 
 
510 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.56 
 
 
453 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  31.42 
 
 
724 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  31.65 
 
 
484 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  30.4 
 
 
462 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  29.49 
 
 
637 aa  190  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  31.6 
 
 
491 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  30.65 
 
 
631 aa  187  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  30.15 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  29.9 
 
 
489 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  31.01 
 
 
462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  29.33 
 
 
440 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  30.98 
 
 
506 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  29.34 
 
 
536 aa  180  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  29.84 
 
 
482 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  30.61 
 
 
486 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.22 
 
 
482 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  30.79 
 
 
438 aa  178  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  27.2 
 
 
478 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.51 
 
 
471 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  30.23 
 
 
558 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  29.54 
 
 
470 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  30 
 
 
481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  29.42 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.65 
 
 
501 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  29.26 
 
 
453 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.84 
 
 
480 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  28.13 
 
 
453 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  27.68 
 
 
533 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  27.07 
 
 
519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  29.76 
 
 
458 aa  167  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  28.4 
 
 
497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  30.02 
 
 
474 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.8 
 
 
497 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  27.92 
 
 
486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.6 
 
 
497 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  27.76 
 
 
500 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  31.78 
 
 
556 aa  162  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.39 
 
 
497 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.39 
 
 
497 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.39 
 
 
497 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.18 
 
 
488 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  26.54 
 
 
578 aa  160  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  28.79 
 
 
457 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  28.01 
 
 
523 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  29.07 
 
 
442 aa  160  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  28.44 
 
 
520 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  28.98 
 
 
457 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  26.74 
 
 
584 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  28.12 
 
 
542 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.05 
 
 
497 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  28.72 
 
 
522 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  28.98 
 
 
517 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  27.57 
 
 
480 aa  156  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  27.68 
 
 
543 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  26.73 
 
 
554 aa  156  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  28.43 
 
 
468 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  27.74 
 
 
513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  27.51 
 
 
440 aa  154  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  26.17 
 
 
536 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  27.7 
 
 
503 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0820  sulfatase  27.54 
 
 
627 aa  154  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  29.07 
 
 
481 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  26.55 
 
 
766 aa  153  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  30.11 
 
 
521 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  27.96 
 
 
555 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  26.95 
 
 
616 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  28.27 
 
 
507 aa  150  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  29.71 
 
 
506 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  26.56 
 
 
536 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  27.59 
 
 
523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  31.51 
 
 
561 aa  148  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  26.87 
 
 
497 aa  148  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  30.7 
 
 
561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  25.9 
 
 
563 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  27.21 
 
 
563 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  25.42 
 
 
520 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>